RIN1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RIN1, Ras and Rab interactor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605965 MGI: 2385695 HomoloGene: 3170 GeneCards: RIN1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинна мембрана • цитоскелет • мембрана • гіалоплазма • дендрит (нейробіологія) • neuronal cell body |
---|
Біологічний процес | • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • ендоцитоз • GO:0072468 сигнальна трансдукція • пам'ять • associative learning • negative regulation of synaptic plasticity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004292 NM_001363559 NM_001363560 |
| | NM_145495 NM_001374051 NM_001374052 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_004283 NP_001350488 NP_001350489 |
| | NP_663470 NP_001360980 NP_001360981 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 66.33 – 66.34 Mb | Хр. 19: 5.1 – 5.11 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RIN1 (англ. Ras and Rab interactor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 783 амінокислот, а молекулярна маса — 84 099[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESPGESGAG | | SPGAPSPSSF | | TTGHLAREKP | | AQDPLYDVPN | | ASGGQAGGPQ |
RPGRVVSLRE | | RLLLTRPVWL | | QLQANAAAAL | | HMLRTEPPGT | | FLVRKSNTRQ |
CQALCMRLPE | | ASGPSFVSSH | | YILESPGGVS | | LEGSELMFPD | | LVQLICAYCH |
TRDILLLPLQ | | LPRAIHHAAT | | HKELEAISHL | | GIEFWSSSLN | | IKAQRGPAGG |
PVLPQLKARS | | PQELDQGTGA | | ALCFFNPLFP | | GDLGPTKREK | | FKRSFKVRVS |
TETSSPLSPP | | AVPPPPVPVL | | PGAVPSQTER | | LPPCQLLRRE | | SSVGYRVPAG |
SGPSLPPMPS | | LQEVDCGSPS | | SSEEEGVPGS | | RGSPATSPHL | | GRRRPLLRSM |
SAAFCSLLAP | | ERQVGRAAAA | | LMQDRHTAAG | | QLVQDLLTQV | | RAGPEPQELQ |
GIRQALSRAR | | AMLSAELGPE | | KLLSPKRLEH | | VLEKSLHCSV | | LKPLRPILAA |
RLRRRLAADG | | SLGRLAEGLR | | LARAQGPGAF | | GSHLSLPSPV | | ELEQVRQKLL |
QLLRTYSPSA | | QVKRLLQACK | | LLYMALRTQE | | GEGAGADEFL | | PLLSLVLAHC |
DLPELLLEAE | | YMSELLEPSL | | LTGEGGYYLT | | SLSASLALLS | | GLGQAHTLPL |
SPVQELRRSL | | SLWEQRRLPA | | THCFQHLLRV | | AYQDPSSGCT | | SKTLAVPPEA |
SIATLNQLCA | | TKFRVTQPNT | | FGLFLYKEQG | | YHRLPPGALA | | HRLPTTGYLV |
YRRAEWPETQ | | GAVTEEEGSG | | QSEARSRGEE | | QGCQGDGDAG | | VKASPRDIRE |
QSETTAEGGQ | | GQAQEGPAQP | | GEPEAEGSRA | | AEE |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.
Література
- Han L., Colicelli J. (1995). A human protein selected for interference with Ras function interacts directly with Ras and competes with Raf1. Mol. Cell. Biol. 15: 1318—1323. PMID 7862125 DOI:10.1128/MCB.15.3.1318
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tall G.G., Barbieri M.A., Stahl P.D., Horazdovsky B.F. (2001). Ras-activated endocytosis is mediated by the Rab5 guanine nucleotide exchange activity of RIN1. Dev. Cell. 1: 73—82. PMID 11703925 DOI:10.1016/S1534-5807(01)00008-9
- Hu H., Bliss J.M., Wang Y., Colicelli J. (2005). RIN1 is an ABL tyrosine kinase activator and a regulator of epithelial-cell adhesion and migration. Curr. Biol. 15: 815—823. PMID 15886098 DOI:10.1016/j.cub.2005.03.049
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18749 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13671 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |