RNF31

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CT7, 4DBG, 4JUY, 4LJO, 4LJP, 4LJQ, 4OWF, 4OYJ, 4OYK, 4P09, 4P0A, 4P0B, 5EDV

Ідентифікатори

Символи

RNF31, HOIP, ZIBRA, ring finger protein 31, Paul

Зовнішні ІД

OMIM: 612487 MGI: 1934704 HomoloGene: 33228 GeneCards: RNF31

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • LUBAC complex • CD40 receptor complex • cytoplasmic side of plasma membrane
Біологічний процес	• positive regulation of protein targeting to mitochondrion • CD40 signaling pathway • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • protein polyubiquitination • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • T cell receptor signaling pathway • protein linear polyubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55072


268749

Ensembl


ENSG00000092098 ENSG00000285152


ENSMUSG00000047098

UniProt


Q96EP0


Q924T7

RefSeq (мРНК)


NM_017999 NM_001310332


NM_194346

RefSeq (білок)


NP_001297261 NP_060469


NP_919327

Локус (UCSC)

Хр. 14: 24.15 – 24.16 Mb

Хр. 14: 55.83 – 55.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF31 (англ. Ring finger protein 31) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 072 амінокислот, а молекулярна маса — 119 652^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGEEEERAF	LVAREELASA	LRRDSGQAFS	LEQLRPLLAS	SLPLAARYLQ
LDAARLVRCN	AHGEPRNYLN	TLSTALNILE	KYGRNLLSPQ	RPRYWRGVKF
NNPVFRSTVD	AVQGGRDVLR	LYGYTEEQPD	GLSFPEGQEE	PDEHQVATVT
LEVLLLRTEL	SLLLQNTHPR	QQALEQLLED	KVEDDMLQLS	EFDPLLREIA
PGPLTTPSVP	GSTPGPCFLC	GSAPGTLHCP	SCKQALCPAC	DHLFHGHPSR
AHHLRQTLPG	VLQGTHLSPS	LPASAQPRPQ	STSLLALGDS	SLSSPNPASA
HLPWHCAACA	MLNEPWAVLC	VACDRPRGCK	GLGLGTEGPQ	GTGGLEPDLA
RGRWACQSCT	FENEAAAVLC	SICERPRLAQ	PPSLVVDSRD	AGICLQPLQQ
GDALLASAQS	QVWYCIHCTF	CNSSPGWVCV	MCNRTSSPIP	AQHAPRPYAS
SLEKGPPKPG	PPRRLSAPLP	SSCGDPEKQR	QDKMREEGLQ	LVSMIREGEA
AGACPEEIFS	ALQYSGTEVP	LQWLRSELPY	VLEMVAELAG	QQDPGLGAFS
CQEARRAWLD	RHGNLDEAVE	ECVRTRRRKV	QELQSLGFGP	EEGSLQALFQ
HGGDVSRALT	ELQRQRLEPF	RQRLWDSGPE	PTPSWDGPDK	QSLVRRLLAV
YALPSWGRAE	LALSLLQETP	RNYELGDVVE	AVRHSQDRAF	LRRLLAQECA
VCGWALPHNR	MQALTSCECT	ICPDCFRQHF	TIALKEKHIT	DMVCPACGRP
DLTDDTQLLS	YFSTLDIQLR	ESLEPDAYAL	FHKKLTEGVL	MRDPKFLWCA
QCSFGFIYER	EQLEATCPQC	HQTFCVRCKR	QWEEQHRGRS	CEDFQNWKRM
NDPEYQAQGL	AMYLQENGID	CPKCKFSYAL	ARGGCMHFHC	TQCRHQFCSG
CYNAFYAKNK	CPEPNCRVKK	SLHGHHPRDC	LFYLRDWTAL	RLQKLLQDNN
VMFNTEPPAG	ARAVPGGGCR	VIEQKEVPNG	LRDEACGKET	PAGYAGLCQA
HYKEYLVSLI	NAHSLDPATL	YEVEELETAT	ERYLHVRPQP	LAGEDPPAYQ
ARLLQKLTEE	VPLGQSIPRR	RK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Thompson H.G.R., Harris J.W., Lin L., Brody J.P. (2004). Identification of the protein Zibra, its genomic organization, regulation, and expression in breast cancer cells. Exp. Cell Res. 295: 448—459. PMID 15093743 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.01.019
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16031 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96EP0 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.