SCYL2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SCYL2, CVAK104, SCY1 like pseudokinase 2, AMCNACC, AMC4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616365 MGI: 1289172 HomoloGene: 13349 GeneCards: SCYL2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ATP binding • signaling receptor binding • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • комплекс Ґольджі • endosome membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • цитоплазма • ендосома • perinuclear region of cytoplasm |
---|
Біологічний процес | • receptor internalization involved in canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein phosphorylation • endosome to lysosome transport • positive regulation of clathrin-dependent endocytosis • positive regulation of receptor internalization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_017988 NM_001317784 NM_001330253 NM_001330254 NM_001330256 |
| | NM_198021 NM_001310704 NM_001358843 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001304713 NP_001317182 NP_001317183 NP_001317185 NP_060458 |
| | NP_001297633 NP_932138 NP_001345772 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 100.27 – 100.34 Mb | Хр. 10: 89.47 – 89.52 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SCYL2 (англ. SCY1 like pseudokinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 929 амінокислот, а молекулярна маса — 103 709[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESMLNKLKS | | TVTKVTADVT | | SAVMGNPVTR | | EFDVGRHIAS | | GGNGLAWKIF |
NGTKKSTKQE | | VAVFVFDKKL | | IDKYQKFEKD | | QIIDSLKRGV | | QQLTRLRHPR |
LLTVQHPLEE | | SRDCLAFCTE | | PVFASLANVL | | GNWENLPSPI | | SPDIKDYKLY |
DVETKYGLLQ | | VSEGLSFLHS | | SVKMVHGNIT | | PENIILNKSG | | AWKIMGFDFC |
VSSTNPSEQE | | PKFPCKEWDP | | NLPSLCLPNP | | EYLAPEYILS | | VSCETASDMY |
SLGTVMYAVF | | NKGKPIFEVN | | KQDIYKSFSR | | QLDQLSRLGS | | SSLTNIPEEV |
REHVKLLLNV | | TPTVRPDADQ | | MTKIPFFDDV | | GAVTLQYFDT | | LFQRDNLQKS |
QFFKGLPKVL | | PKLPKRVIVQ | | RILPCLTSEF | | VNPDMVPFVL | | PNVLLIAEEC |
TKEEYVKLIL | | PELGPVFKQQ | | EPIQILLIFL | | QKMDLLLTKT | | PPDEIKNSVL |
PMVYRALEAP | | SIQIQELCLN | | IIPTFANLID | | YPSMKNALIP | | RIKNACLQTS |
SLAVRVNSLV | | CLGKILEYLD | | KWFVLDDILP | | FLQQIPSKEP | | AVLMGILGIY |
KCTFTHKKLG | | ITKEQLAGKV | | LPHLIPLSIE | | NNLNLNQFNS | | FISVIKEMLN |
RLESEHKTKL | | EQLHIMQEQQ | | KSLDIGNQMN | | VSEEMKVTNI | | GNQQIDKVFN |
NIGADLLTGS | | ESENKEDGLQ | | NKHKRASLTL | | EEKQKLAKEQ | | EQAQKLKSQQ |
PLKPQVHTPV | | ATVKQTKDLT | | DTLMDNMSSL | | TSLSVSTPKS | | SASSTFTSVP |
SMGIGMMFST | | PTDNTKRNLT | | NGLNANMGFQ | | TSGFNMPVNT | | NQNFYSSPST |
VGVTKMTLGT | | PPTLPNFNAL | | SVPPAGAKQT | | QQRPTDMSAL | | NNLFGPQKPK |
VSMNQLSQQK | | PNQWLNQFVP | | PQGSPTMGSS | | VMGTQMNVIG | | QSAFGMQGNP |
FFNPQNFAQP | | PTTMTNSSSA | | SNDLKDLFG |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- Conner S.D., Schmid S.L. (2005). CVAK104 is a novel poly-L-lysine-stimulated kinase that targets the beta2-subunit of AP2. J. Biol. Chem. 280: 21539—21544. PMID 15809293 DOI:10.1074/jbc.M502462200
- Duewel M., Ungewickell E.J. (2006). Clathrin-dependent association of CVAK104 with endosomes and the trans-Golgi network. Mol. Biol. Cell. 17: 4513—4525. PMID 16914521 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0390
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19286 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q6P3W7 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |