SDC2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SDC2, CD362, HSPG, HSPG1, SYND2, syndecan 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142460 MGI: 1349165 HomoloGene: 2253 GeneCards: SDC2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal lumen • Golgi lumen • endoplasmic reticulum lumen • cell surface • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • glycosaminoglycan metabolic process • диференціація клітин • ephrin receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • retinoid metabolic process • regulation of dendrite morphogenesis • біолюмінесценція • glycosaminoglycan catabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • leukocyte migration • посттрансляційна модифікація • cell migration • dendrite morphogenesis • GO:0022610 життєдіяльність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 96.49 – 96.61 Mb | Хр. 15: 32.92 – 33.04 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SDC2 (англ. Syndecan 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 160[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRRAWILLTL | | GLVACVSAES | | RAELTSDKDM | | YLDNSSIEEA | | SGVYPIDDDD |
YASASGSGAD | | EDVESPELTT | | SRPLPKILLT | | SAAPKVETTT | | LNIQNKIPAQ |
TKSPEETDKE | | KVHLSDSERK | | MDPAEEDTNV | | YTEKHSDSLF | | KRTEVLAAVI |
AGGVIGFLFA | | IFLILLLVYR | | MRKKDEGSYD | | LGERKPSSAA | | YQKAPTKEFY |
A |
Кодований геном білок за функціями належить до світлочутливих білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як люмінесценція, диференціація клітин, нейрогенез. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
- Marynen P., Zhang J., Cassiman J.-J., den Berghe H., David G. (1989). Partial primary structure of the 48- and 90-kilodalton core proteins of cell surface-associated heparan sulfate proteoglycans of lung fibroblasts. Prediction of an integral membrane domain and evidence for multiple distinct core proteins at the cell surface of human lung fibroblasts. J. Biol. Chem. 264: 7017—7024. PMID 2523388
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10659 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P34741 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |