SEC24C |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEC24C, SEC24 homolog C, COPII coat complex component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607185 MGI: 1919746 HomoloGene: 3615 GeneCards: SEC24C |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • COPII vesicle coat • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • in utero embryonic development • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 73.74 – 73.77 Mb | Хр. 14: 20.72 – 20.74 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEC24C (англ. SEC24 homolog C, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 094 амінокислот, а молекулярна маса — 118 325[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNVNQSVPPV | | PPFGQPQPIY | | PGYHQSSYGG | | QSGSTAPAIP | | YGAYNGPVPG |
YQQTPPQGMS | | RAPPSSGAPP | | ASTAQAPCGQ | | AAYGQFGQGD | | VQNGPSSTVQ |
MQRLPGSQPF | | GSPLAPVGNQ | | PPVLQPYGPP | | PTSAQVATQL | | SGMQISGAVA |
PAPPSSGLGF | | GPPTSLASAS | | GSFPNSGLYG | | SYPQGQAPPL | | SQAQGHPGIQ |
TPQRSAPSQA | | SSFTPPASGG | | PRLPSMTGPL | | LPGQSFGGPS | | VSQPNHVSSP |
PQALPPGTQM | | TGPLGPLPPM | | HSPQQPGYQP | | QQNGSFGPAR | | GPQSNYGGPY |
PAAPTFGSQP | | GPPQPLPPKR | | LDPDAIPSPI | | QVIEDDRNNR | | GTEPFVTGVR |
GQVPPLVTTN | | FLVKDQGNAS | | PRYIRCTSYN | | IPCTSDMAKQ | | AQVPLAAVIK |
PLARLPPEEA | | SPYVVDHGES | | GPLRCNRCKA | | YMCPFMQFIE | | GGRRFQCCFC |
SCINDVPPQY | | FQHLDHTGKR | | VDAYDRPELS | | LGSYEFLATV | | DYCKNNKFPS |
PPAFIFMIDV | | SYNAIRTGLV | | RLLCEELKSL | | LDFLPREGGA | | EESAIRVGFV |
TYNKVLHFYN | | VKSSLAQPQM | | MVVSDVADMF | | VPLLDGFLVN | | VNESRAVITS |
LLDQIPEMFA | | DTRETETVFV | | PVIQAGMEAL | | KAAECAGKLF | | LFHTSLPIAE |
APGKLKNRDD | | RKLINTDKEK | | TLFQPQTGAY | | QTLAKECVAQ | | GCCVDLFLFP |
NQYVDVATLS | | VVPQLTGGSV | | YKYASFQVEN | | DQERFLSDLR | | RDVQKVVGFD |
AVMRVRTSTG | | IRAVDFFGAF | | YMSNTTDVEL | | AGLDGDKTVT | | VEFKHDDRLN |
EESGALLQCA | | LLYTSCAGQR | | RLRIHNLALN | | CCTQLADLYR | | NCETDTLINY |
MAKFAYRGVL | | NSPVKAVRDT | | LITQCAQILA | | CYRKNCASPS | | SAGQLILPEC |
MKLLPVYLNC | | VLKSDVLQPG | | AEVTTDDRAY | | VRQLVTSMDV | | TETNVFFYPR |
LLPLTKSPVE | | STTEPPAVRA | | SEERLSNGDI | | YLLENGLNLF | | LWVGASVQQG |
VVQSLFSVSS | | FSQITSGLSV | | LPVLDNPLSK | | KVRGLIDSLR | | AQRSRYMKLT |
VVKQEDKMEM | | LFKHFLVEDK | | SLSGGASYVD | | FLCHMHKEIR | | QLLS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tani K., Oyama Y., Hatsuzawa K., Tagaya M. (1999). Hypothetical protein KIAA0079 is a mammalian homologue of yeast Sec24p. FEBS Lett. 447: 247—250. PMID 10214955 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00303-8
- Tang B.L., Kausalya J., Low D.Y.H., Lock M.L., Hong W. (1999). A family of mammalian proteins homologous to yeast Sec24p. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258: 679—684. PMID 10329445 DOI:10.1006/bbrc.1999.0574
- Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
- Bonnon C., Wendeler M.W., Paccaud J.P., Hauri H.P. (2010). Selective export of human GPI-anchored proteins from the endoplasmic reticulum. J. Cell Sci. 123: 1705—1715. PMID 20427317 DOI:10.1242/jcs.062950
- Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10705 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P53992 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |