SEMA3B |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEMA3B, LUCA-1, SEMA5, SEMAA, SemA, semaV, semaphorin 3B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601281 MGI: 107561 HomoloGene: 20972 GeneCards: SEMA3B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • axon guidance • cell-cell signaling • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • chemorepulsion of axon • semaphorin-plexin signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001005914 NM_001290060 NM_001290061 NM_001290062 NM_001290063
| NM_004636 |
| | NM_001042779 NM_001291537 NM_001291538 NM_001291539 NM_009153 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001005914 NP_001276989 NP_001276990 NP_001276991 NP_001276992
| NP_004627 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 50.27 – 50.28 Mb | Хр. 9: 107.47 – 107.49 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEMA3B (англ. Semaphorin 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 749 амінокислот, а молекулярна маса — 83 122[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGRAGAAAVI | | PGLALLWAVG | | LGSAAPSPPR | | LRLSFQELQA | | WHGLQTFSLE |
RTCCYQALLV | | DEERGRLFVG | | AENHVASLNL | | DNISKRAKKL | | AWPAPVEWRE |
ECNWAGKDIG | | TECMNFVKLL | | HAYNRTHLLA | | CGTGAFHPTC | | AFVEVGHRAE |
EPVLRLDPGR | | IEDGKGKSPY | | DPRHRAASVL | | VGEELYSGVA | | ADLMGRDFTI |
FRSLGQRPSL | | RTEPHDSRWL | | NEPKFVKVFW | | IPESENPDDD | | KIYFFFRETA |
VEAAPALGRL | | SVSRVGQICR | | NDVGGQRSLV | | NKWTTFLKAR | | LVCSVPGVEG |
DTHFDQLQDV | | FLLSSRDHRT | | PLLYAVFSTS | | SSIFQGSAVC | | VYSMNDVRRA |
FLGPFAHKEG | | PMHQWVSYQG | | RVPYPRPGMC | | PSKTFGTFSS | | TKDFPDDVIQ |
FARNHPLMYN | | SVLPTGGRPL | | FLQVGANYTF | | TQIAADRVAA | | ADGHYDVLFI |
GTDVGTVLKV | | ISVPKGSRPS | | AEGLLLEELH | | VFEDSAAVTS | | MQISSKRHQL |
YVASRSAVAQ | | IALHRCAAHG | | RVCTECCLAR | | DPYCAWDGVA | | CTRFQPSAKR |
RFRRQDVRNG | | DPSTLCSGDS | | SRPALLEHKV | | FGVEGSSAFL | | ECEPRSLQAR |
VEWTFQRAGV | | TAHTQVLAEE | | RTERTARGLL | | LRRLRRRDSG | | VYLCAAVEQG |
FTQPLRRLSL | | HVLSATQAER | | LARAEEAAPA | | APPGPKLWYR | | DFLQLVEPGG |
GGSANSLRMC | | RPQPALQSLP | | LESRRKGRNR | | RTHAPEPRAE | | RGPRSATHW |
Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lerman M.I., Minna J.D. (2000). The 630-kb lung cancer homozygous deletion region on human chromosome 3p21.3: identification and evaluation of the resident candidate tumor suppressor genes. Cancer Res. 60: 6116—6133. PMID 11085536
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10724 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13214 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |