SEMA3F |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEMA3F, SEMA-IV, SEMA4, SEMAK, semaphorin 3F |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601124 MGI: 1096347 HomoloGene: 20885 GeneCards: SEMA3F |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • chemorepellent activity • neuropilin binding • semaphorin receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • міжклітинний простір • glutamatergic synapse • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • sympathetic ganglion development • ventral trunk neural crest cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway involved in neuron projection guidance • negative chemotaxis • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance • axon guidance • sympathetic neuron projection guidance • neural crest cell migration involved in autonomic nervous system development • branchiomotor neuron axon guidance • facial nerve structural organization • nerve development • sympathetic neuron projection extension • trigeminal nerve structural organization • axon extension involved in axon guidance • neural crest cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • regulation of postsynapse organization • positive regulation of cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004186 NM_001318798 NM_001318800 |
| | NM_011349 NM_001311151 NM_001379496 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001305727 NP_001305729 NP_004177 |
| NP_001298080 NP_035479 NP_001366425 NP_001391952 NP_001391953
| NP_001391954 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 50.16 – 50.19 Mb | Хр. 9: 107.56 – 107.59 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEMA3F (англ. Semaphorin 3F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 88 381[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLVAGLLLWA | | SLLTGAWPSF | | PTQDHLPATP | | RVRLSFKELK | | ATGTAHFFNF |
LLNTTDYRIL | | LKDEDHDRMY | | VGSKDYVLSL | | DLHDINREPL | | IIHWAASPQR |
IEECVLSGKD | | VNGECGNFVR | | LIQPWNRTHL | | YVCGTGAYNP | | MCTYVNRGRR |
AQATPWTQTQ | | AVRGRGSRAT | | DGALRPMPTA | | PRQDYIFYLE | | PERLESGKGK |
CPYDPKLDTA | | SALINEELYA | | GVYIDFMGTD | | AAIFRTLGKQ | | TAMRTDQYNS |
RWLNDPSFIH | | AELIPDSAER | | NDDKLYFFFR | | ERSAEAPQSP | | AVYARIGRIC |
LNDDGGHCCL | | VNKWSTFLKA | | RLVCSVPGED | | GIETHFDELQ | | DVFVQQTQDV |
RNPVIYAVFT | | SSGSVFRGSA | | VCVYSMADIR | | MVFNGPFAHK | | EGPNYQWMPF |
SGKMPYPRPG | | TCPGGTFTPS | | MKSTKDYPDE | | VINFMRSHPL | | MYQAVYPLQR |
RPLVVRTGAP | | YRLTTIAVDQ | | VDAADGRYEV | | LFLGTDRGTV | | QKVIVLPKDD |
QELEELMLEE | | VEVFKDPAPV | | KTMTISSKRQ | | QLYVASAVGV | | THLSLHRCQA |
YGAACADCCL | | ARDPYCAWDG | | QACSRYTASS | | KRRSRRQDVR | | HGNPIRQCRG |
FNSNANKNAV | | ESVQYGVAGS | | AAFLECQPRS | | PQATVKWLFQ | | RDPGDRRREI |
RAEDRFLRTE | | QGLLLRALQL | | SDRGLYSCTA | | TENNFKHVVT | | RVQLHVLGRD |
AVHAALFPPL | | SMSAPPPPGA | | GPPTPPYQEL | | AQLLAQPEVG | | LIHQYCQGYW |
RHVPPSPREA | | PGAPRSPEPQ | | DQKKPRNRRH | | HPPDT |
Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10728 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13275 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |