SEMA4A |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEMA4A, CORD10, RP35, SEMAB, SEMB, semaphorin 4A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607292 MGI: 107560 HomoloGene: 8425 GeneCards: SEMA4A |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
retinitis pigmentosa 35, cone-rod dystrophy 10[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинне ядро • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинна мембрана • міжклітинний простір • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • адаптивна імунна відповідь • аксоноґенеза • процес імунної системи • T-helper 1 cell differentiation • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • Ангіогенез • regulation of endothelial cell migration • regulation of cell shape • negative regulation of angiogenesis • T cell differentiation involved in immune response • semaphorin-plexin signaling pathway • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • positive regulation of excitatory synapse assembly • positive regulation of inhibitory synapse assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001193300 NM_001193301 NM_001193302 NM_022367 NM_001370567
| NM_001370568 NM_001370569 NM_001370571 |
| | NM_001163489 NM_001163490 NM_001163491 NM_013658 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001180229 NP_001180230 NP_001180231 NP_071762 NP_001357496
| NP_001357497 NP_001357498 NP_001357500 |
| | NP_001156961 NP_001156962 NP_001156963 NP_038686 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 156.15 – 156.18 Mb | Хр. 3: 88.34 – 88.37 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEMA4A (англ. Semaphorin 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 761 амінокислот, а молекулярна маса — 83 574[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALPALGLDP | | WSLLGLFLFQ | | LLQLLLPTTT | | AGGGGQGPMP | | RVRYYAGDER |
RALSFFHQKG | | LQDFDTLLLS | | GDGNTLYVGA | | REAILALDIQ | | DPGVPRLKNM |
IPWPASDRKK | | SECAFKKKSN | | ETQCFNFIRV | | LVSYNVTHLY | | TCGTFAFSPA |
CTFIELQDSY | | LLPISEDKVM | | EGKGQSPFDP | | AHKHTAVLVD | | GMLYSGTMNN |
FLGSEPILMR | | TLGSQPVLKT | | DNFLRWLHHD | | ASFVAAIPST | | QVVYFFFEET |
ASEFDFFERL | | HTSRVARVCK | | NDVGGEKLLQ | | KKWTTFLKAQ | | LLCTQPGQLP |
FNVIRHAVLL | | PADSPTAPHI | | YAVFTSQWQV | | GGTRSSAVCA | | FSLLDIERVF |
KGKYKELNKE | | TSRWTTYRGP | | ETNPRPGSCS | | VGPSSDKALT | | FMKDHFLMDE |
QVVGTPLLVK | | SGVEYTRLAV | | ETAQGLDGHS | | HLVMYLGTTT | | GSLHKAVVSG |
DSSAHLVEEI | | QLFPDPEPVR | | NLQLAPTQGA | | VFVGFSGGVW | | RVPRANCSVY |
ESCVDCVLAR | | DPHCAWDPES | | RTCCLLSAPN | | LNSWKQDMER | | GNPEWACASG |
PMSRSLRPQS | | RPQIIKEVLA | | VPNSILELPC | | PHLSALASYY | | WSHGPAAVPE |
ASSTVYNGSL | | LLIVQDGVGG | | LYQCWATENG | | FSYPVISYWV | | DSQDQTLALD |
PELAGIPREH | | VKVPLTRVSG | | GAALAAQQSY | | WPHFVTVTVL | | FALVLSGALI |
ILVASPLRAL | | RARGKVQGCE | | TLRPGEKAPL | | SREQHLQSPK | | ECRTSASDVD |
ADNNCLGTEV | | A |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, ангіогенез, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Abid A., Ismail M., Mehdi S.Q., Khaliq S. (2006). Identification of novel mutations in the SEMA4A gene associated with retinal degenerative diseases. J. Med. Genet. 43: 378—381. PMID 16199541 DOI:10.1136/jmg.2005.035055
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SEMA4A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10729 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9H3S1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |