SERBP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SERBP1, CHD3IP, HABP4L, PAI-RBP1, PAIRBP1, CGI-55, SERPINE1 mRNA binding protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607378 MGI: 1914120 HomoloGene: 134277 GeneCards: SERBP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA 3'-UTR binding • RNA binding • cadherin binding • SUMO binding |
---|
Клітинна компонента | • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of apoptotic process • regulation of mRNA stability • PML body organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_015640 NM_001018067 NM_001018068 NM_001018069 |
| | NM_001113564 NM_001113565 NM_001113566 NM_025814 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001018077 NP_001018078 NP_001018079 NP_056455 |
| | NP_001107036 NP_001107037 NP_001107038 NP_080090 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 67.41 – 67.43 Mb | Хр. 6: 67.22 – 67.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SERBP1 (англ. SERPINE1 mRNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 408 амінокислот, а молекулярна маса — 44 965[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPGHLQEGFG | | CVVTNRFDQL | | FDDESDPFEV | | LKAAENKKKE | | AGGGGVGGPG |
AKSAAQAAAQ | | TNSNAAGKQL | | RKESQKDRKN | | PLPPSVGVVD | | KKEETQPPVA |
LKKEGIRRVG | | RRPDQQLQGE | | GKIIDRRPER | | RPPRERRFEK | | PLEEKGEGGE |
FSVDRPIIDR | | PIRGRGGLGR | | GRGGRGRGMG | | RGDGFDSRGK | | REFDRHSGSD |
RSSFSHYSGL | | KHEDKRGGSG | | SHNWGTVKDE | | LTESPKYIQK | | QISYNYSDLD |
QSNVTEETPE | | GEEHHPVADT | | ENKENEVEEV | | KEEGPKEMTL | | DEWKAIQNKD |
RAKVEFNIRK | | PNEGADGQWK | | KGFVLHKSKS | | EEAHAEDSVM | | DHHFRKPAND |
ITSQLEINFG | | DLGRPGRGGR | | GGRGGRGRGG | | RPNRGSRTDK | | SSASAPDVDD |
PEAFPALA |
Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. (2003). Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3. FEBS Lett. 533: 14—20. PMID 12505151 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03737-7
- Heaton J.H., Dlakic W.M., Dlakic M., Gelehrter T.D. (2001). Identification and cDNA cloning of a novel RNA-binding protein that interacts with the cyclic nucleotide-responsive sequence in the type-1 plasminogen activator inhibitor mRNA. J. Biol. Chem. 276: 3341—3347. PMID 11001948 DOI:10.1074/jbc.M006538200
- Goulet I., Boisvenue S., Mokas S., Mazroui R., Cote J. (2008). TDRD3, a novel Tudor domain-containing protein, localizes to cytoplasmic stress granules. Hum. Mol. Genet. 17: 3055—3074. PMID 18632687 DOI:10.1093/hmg/ddn203
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17860 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8NC51 (англ.) . Архів оригіналу за 9 травня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |