SERINC3

Ідентифікатори

Символи

SERINC3, AIGP1, DIFF33, SBBI99, TDE, TDE1, TMS-1, serine incorporator 3

Зовнішні ІД

OMIM: 607165 MGI: 1349457 HomoloGene: 38230 GeneCards: SERINC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• L-serine transmembrane transporter activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана
Біологічний процес	• phosphatidylserine metabolic process • detection of virus • вроджений імунітет • defense response to virus • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • sphingolipid metabolic process • L-serine transport • процес імунної системи • L-serine biosynthetic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10955


26943

Ensembl


ENSG00000132824


ENSMUSG00000017707

UniProt


Q13530


Q9QZI9

RefSeq (мРНК)


NM_198941 NM_006811


NM_012032

RefSeq (білок)


NP_006802 NP_945179


NP_036162

Локус (UCSC)

Хр. 20: 44.5 – 44.52 Mb

Хр. 2: 163.47 – 163.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SERINC3 (англ. Serine incorporator 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 52 580^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAVLGVFSL	ASWVPCLCSG	ASCLLCSCCP	NSKNSTVTRL	IYAFILLLST
VVSYIMQRKE	METYLKKIPG	FCEGGFKIHE	ADINADKDCD	VLVGYKAVYR
ISFAMAIFFF	VFSLLMFKVK	TSKDLRAAVH	NGFWFFKIAA	LIGIMVGSFY
IPGGYFSSVW	FVVGMIGAAL	FILIQLVLLV	DFAHSWNESW	VNRMEEGNPR
LWYAALLSFT	SAFYILSIIC	VGLLYTYYTK	PDGCTENKFF	ISINLILCVV
ASIISIHPKI	QEHQPRSGLL	QSSLITLYTM	YLTWSAMSNE	PDRSCNPNLM
SFITRITAPT	LAPGNSTAVV	PTPTPPSKSG	SLLDSDNFIG	LFVFVLCLLY
SSIRTSTNSQ	VDKLTLSGSD	SVILGDTTTS	GASDEEDGQP	RRAVDNEKEG
VQYSYSLFHL	MLCLASLYIM	MTLTSWYSPD	AKFQSMTSKW	PAVWVKISSS
WVCLLLYVWT	LVAPLVLTSR	DFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

Bossolasco M., Lebel M., Lemieux N., Mes-Masson A.-M. (1999). The human TDE gene homologue: localization to 20q13.1-13.3 and variable expression in human tumor cell lines and tissue. Mol. Carcinog. 26: 189—200. PMID 10559794 DOI:10.1002/(SICI)1098-2744(199911)26:3<189::AID-MC8>3.0.CO;2-T
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Usami Y., Wu Y., Goettlinger H.G. (2015). SERINC3 and SERINC5 restrict HIV-1 infectivity and are counteracted by Nef. Nature. 526: 218—223. PMID 26416733 DOI:10.1038/nature15400

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11699 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13530 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.