SF3A3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SF3A3, PRP9, PRPF9, SAP61, SF3a60, splicing factor 3a subunit 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605596 MGI: 1922312 HomoloGene: 4949 GeneCards: SF3A3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2 snRNP • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • U2-type prespliceosome assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 37.96 – 37.99 Mb | Хр. 4: 124.61 – 124.63 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SF3A3 (англ. Splicing factor 3a subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 58 849[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
METILEQQRR | | YHEEKERLMD | | VMAKEMLTKK | | STLRDQINSD | | HRTRAMQDRY |
MEVSGNLRDL | | YDDKDGLRKE | | ELNAISGPNE | | FAEFYNRLKQ | | IKEFHRKHPN |
EICVPMSVEF | | EELLKARENP | | SEEAQNLVEF | | TDEEGYGRYL | | DLHDCYLKYI |
NLKASEKLDY | | ITYLSIFDQL | | FDIPKERKNA | | EYKRYLEMLL | | EYLQDYTDRV |
KPLQDQNELF | | GKIQAEFEKK | | WENGTFPGWP | | KETSSALTHA | | GAHLDLSAFS |
SWEELASLGL | | DRLKSALLAL | | GLKCGGTLEE | | RAQRLFSTKG | | KSLESLDTSL |
FAKNPKSKGT | | KRDTERNKDI | | AFLEAQIYEY | | VEILGEQRHL | | THENVQRKQA |
RTGEEREEEE | | EEQISESESE | | DEENEIIYNP | | KNLPLGWDGK | | PIPYWLYKLH |
GLNINYNCEI | | CGNYTYRGPK | | AFQRHFAEWR | | HAHGMRCLGI | | PNTAHFANVT |
QIEDAVSLWA | | KLKLQKASER | | WQPDTEEEYE | | DSSGNVVNKK | | TYEDLKRQGL |
L |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- Chiara M.D., Champion-Arnaud P., Buvoli M., Nadal-Ginard B., Reed R. (1994). Specific protein-protein interactions between the essential mammalian spliceosome-associated proteins SAP 61 and SAP 114. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6403—6407. PMID 8022796 DOI:10.1073/pnas.91.14.6403
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10767 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q12874 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |