SFTPB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1DFW, 1KMR, 1RG3, 1RG4, 1SSZ, 2DWF, 2JOU, 2M0H, 2M1T

Ідентифікатори

Символи

SFTPB, PSP-B, SFTB3, SFTP3, SMDP1, SP-B, surfactant protein B, Surfactant protein B

Зовнішні ІД

OMIM: 178640 MGI: 109516 HomoloGene: 456 GeneCards: SFTPB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0010577 enzyme activator activity • G protein-coupled receptor binding
Клітинна компонента	• multivesicular body • extracellular region • clathrin-coated endocytic vesicle • лізосома • lamellar granule • endoplasmic reticulum membrane • alveolar lamellar body • multivesicular body lumen • нуклеоплазма • міжклітинний простір
Біологічний процес	• animal organ morphogenesis • respiratory gaseous exchange by respiratory system • sphingolipid metabolic process • lipid metabolism • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6439


20388

Ensembl


ENSG00000168878


ENSMUSG00000056370

UniProt


P07988


P50405

RefSeq (мРНК)


NM_000542 NM_198843 NM_001367281


NM_001282071 NM_147779

RefSeq (білок)


NP_000533 NP_942140 NP_001354210


NP_001269000 NP_680088

Локус (UCSC)

Хр. 2: 85.66 – 85.67 Mb

Хр. 6: 72.28 – 72.29 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SFTPB (англ. Surfactant protein B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 381 амінокислот, а молекулярна маса — 42 117^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAESHLLQWL	LLLLPTLCGP	GTAAWTTSSL	ACAQGPEFWC	QSLEQALQCR
ALGHCLQEVW	GHVGADDLCQ	ECEDIVHILN	KMAKEAIFQD	TMRKFLEQEC
NVLPLKLLMP	QCNQVLDDYF	PLVIDYFQNQ	TDSNGICMHL	GLCKSRQPEP
EQEPGMSDPL	PKPLRDPLPD	PLLDKLVLPV	LPGALQARPG	PHTQDLSEQQ
FPIPLPYCWL	CRALIKRIQA	MIPKGALAVA	VAQVCRVVPL	VAGGICQCLA
ERYSVILLDT	LLGRMLPQLV	CRLVLRCSMD	DSAGPRSPTG	EWLPRDSECH
LCMSVTTQAG	NSSEQAIPQA	MLQACVGSWL	DREKCKQFVE	QHTPQLLTLV
PRGWDAHTTC	QALGVCGTMS	SPLQCIHSPD	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Johansson J., Joernvall H., Curstedt T. (1992). Human surfactant polypeptide SP-B. Disulfide bridges, C-terminal end, and peptide analysis of the airway form. FEBS Lett. 301: 165—167. PMID 1568474 DOI:10.1016/0014-5793(92)81239-I
Sarker M., Waring A.J., Walther F.J., Keough K.M., Booth V. (2007). Structure of mini-B, a functional fragment of surfactant protein B, in detergent micelles. Biochemistry. 46: 11047—11056. PMID 17845058 DOI:10.1021/bi7011756
Haataja R., Raemet M., Marttila R., Hallman M. (2000). Surfactant proteins A and B as interactive genetic determinants of neonatal respiratory distress syndrome. Hum. Mol. Genet. 9: 2751—2760. PMID 11063734 DOI:10.1093/hmg/9.18.2751

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10801 (англ.) . Архів оригіналу за 15 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P07988 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.