SHROOM3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SHROOM3, APXL3, SHRM, ShrmL, MSTP013, shroom family member 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604570 MGI: 1351655 HomoloGene: 9263 GeneCards: SHROOM3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
захворювання нирок[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin filament binding • actin binding |
---|
Клітинна компонента | • apical plasma membrane • міжклітинні контакти • Адгезивні контакти • цитоплазма • apical junction complex • мікротрубочка • цитоскелет • cortical actin cytoskeleton |
---|
Біологічний процес | • cellular pigment accumulation • multicellular organism development • apical protein localization • regulation of cell shape • neural tube closure • epithelial cell development • pattern specification process • GO:0000767 cell morphogenesis • actin filament organization • actin cytoskeleton organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001077595 NM_001077596 NM_015756 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001071063 NP_001071064 NP_056571 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 76.44 – 76.78 Mb | Хр. 5: 92.83 – 93.11 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SHROOM3 (англ. Shroom family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 996 амінокислот, а молекулярна маса — 216 857[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMRTTEDFHK | | PSATLNSNTA | | TKGRYIYLEA | | FLEGGAPWGF | | TLKGGLEHGE |
PLIISKVEEG | | GKADTLSSKL | | QAGDEVVHIN | | EVTLSSSRKE | | AVSLVKGSYK |
TLRLVVRRDV | | CTDPGHADTG | | ASNFVSPEHL | | TSGPQHRKAA | | WSGGVKLRLK |
HRRSEPAGRP | | HSWHTTKSGE | | KQPDASMMQI | | SQGMIGPPWH | | QSYHSSSSTS |
DLSNYDHAYL | | RRSPDQCSSQ | | GSMESLEPSG | | AYPPCHLSPA | | KSTGSIDQLS |
HFHNKRDSAY | | SSFSTSSSIL | | EYPHPGISGR | | ERSGSMDNTS | | ARGGLLEGMR |
QADIRYVKTV | | YDTRRGVSAE | | YEVNSSALLL | | QGREARASAN | | GQGYDKWSNI |
PRGKGVPPPS | | WSQQCPSSLE | | TATDNLPPKV | | GAPLPPARSD | | SYAAFRHRER |
PSSWSSLDQK | | RLCRPQANSL | | GSLKSPFIEE | | QLHTVLEKSP | | ENSPPVKPKH |
NYTQKAQPGQ | | PLLPTSIYPV | | PSLEPHFAQV | | PQPSVSSNGM | | LYPALAKESG |
YIAPQGACNK | | MATIDENGNQ | | NGSGRPGFAF | | CQPLEHDLLS | | PVEKKPEATA |
KYVPSKVHFC | | SVPENEEDAS | | LKRHLTPPQG | | NSPHSNERKS | | THSNKPSSHP |
HSLKCPQAQA | | WQAGEDKRSS | | RLSEPWEGDF | | QEDHNANLWR | | RLEREGLGQS |
LSGNFGKTKS | | AFSSLQNIPE | | SLRRHSSLEL | | GRGTQEGYPG | | GRPTCAVNTK |
AEDPGRKAAP | | DLGSHLDRQV | | SYPRPEGRTG | | ASASFNSTDP | | SPEEPPAPSH |
PHTSSLGRRG | | PGPGSASALQ | | GFQYGKPHCS | | VLEKVSKFEQ | | REQGSQRPSV |
GGSGFGHNYR | | PHRTVSTSST | | SGNDFEETKA | | HIRFSESAEP | | LGNGEQHFKN |
GELKLEEASR | | QPCGQQLSGG | | ASDSGRGPQR | | PDARLLRSQS | | TFQLSSEPER |
EPEWRDRPGS | | PESPLLDAPF | | SRAYRNSIKD | | AQSRVLGATS | | FRRRDLELGA |
PVASRSWRPR | | PSSAHVGLRS | | PEASASASPH | | TPRERHSVTP | | AEGDLARPVP |
PAARRGARRR | | LTPEQKKRSY | | SEPEKMNEVG | | IVEEAEPAPL | | GPQRNGMRFP |
ESSVADRRRL | | FERDGKACST | | LSLSGPELKQ | | FQQSALADYI | | QRKTGKRPTS |
AAGCSLQEPG | | PLRERAQSAY | | LQPGPAALEG | | SGLASASSLS | | SLREPSLQPR |
REATLLPATV | | AETQQAPRDR | | SSSFAGGRRL | | GERRRGDLLS | | GANGGTRGTQ |
RGDETPREPS | | SWGARAGKSM | | SAEDLLERSD | | VLAGPVHVRS | | RSSPATADKR |
QDVLLGQDSG | | FGLVKDPCYL | | AGPGSRSLSC | | SERGQEEMLP | | LFHHLTPRWG |
GSGCKAIGDS | | SVPSECPGTL | | DHQRQASRTP | | CPRPPLAGTQ | | GLVTDTRAAP |
LTPIGTPLPS | | AIPSGYCSQD | | GQTGRQPLPP | | YTPAMMHRSN | | GHTLTQPPGP |
RGCEGDGPEH | | GVEEGTRKRV | | SLPQWPPPSR | | AKWAHAARED | | SLPEESSAPD |
FANLKHYQKQ | | QSLPSLCSTS | | DPDTPLGAPS | | TPGRISLRIS | | ESVLRDSPPP |
HEDYEDEVFV | | RDPHPKATSS | | PTFEPLPPPP | | PPPPSQETPV | | YSMDDFPPPP |
PHTVCEAQLD | | SEDPEGPRPS | | FNKLSKVTIA | | RERHMPGAAH | | VVGSQTLASR |
LQTSIKGSEA | | ESTPPSFMSV | | HAQLAGSLGG | | QPAPIQTQSL | | SHDPVSGTQG |
LEKKVSPDPQ | | KSSEDIRTEA | | LAKEIVHQDK | | SLADILDPDS | | RLKTTMDLME |
GLFPRDVNLL | | KENSVKRKAI | | QRTVSSSGCE | | GKRNEDKEAV | | SMLVNCPAYY |
SVSAPKAELL | | NKIKEMPAEV | | NEEEEQADVN | | EKKAELIGSL | | THKLETLQEA |
KGSLLTDIKL | | NNALGEEVEA | | LISELCKPNE | | FDKYRMFIGD | | LDKVVNLLLS |
LSGRLARVEN | | VLSGLGEDAS | | NEERSSLYEK | | RKILAGQHED | | ARELKENLDR |
RERVVLGILA | | NYLSEEQLQD | | YQHFVKMKST | | LLIEQRKLDD | | KIKLGQEQVK |
CLLESLPSDF | | IPKAGALALP | | PNLTSEPIPA | | GGCTFSGIFP | | TLTSPL |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SHROOM3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30422 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8TF72 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |