SIRT2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1J8F, 3ZGO, 3ZGV, 4L3O, 4R8M, 4RMG, 4RMH, 4RMI, 4RMJ, 4Y6O, 5DY4, 5D7O, 5DY5, 4Y6L, 4Y6Q, 4X3O, 4X3P, 5D7P, 5D7Q, 5FYQ

Ідентифікатори

Символи

SIRT2, SIR2, SIR2L, SIR2L2, sirtuin 2

Зовнішні ІД

OMIM: 604480 MGI: 1927664 HomoloGene: 40823 GeneCards: SIRT2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone deacetylase binding • transcription factor binding • зв'язування з іоном металу • protein deacetylase activity • zinc ion binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • tubulin deacetylase activity • NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific) • NAD-dependent protein deacetylase activity • histone deacetylase activity • ubiquitin binding • NAD+ binding • beta-tubulin binding • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • hydrolase activity • NAD-dependent histone deacetylase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • центр організації мікротрубочок • chromatin silencing complex • perinuclear region of cytoplasm • paranode region of axon • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • центросома • cell projection • myelin sheath • glial cell projection • Schmidt-Lanterman incisure • paranodal junction • перикаріон • growth cone • веретено поділу • хромосома • lateral loop • mitotic spindle • meiotic spindle • midbody • Центріоль • juxtaparanode region of axon • теломера • ядерце • мітохондрія • клітинна мембрана
Біологічний процес	• cellular response to molecule of bacterial origin • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process involved in cellular response to hypoxia • cellular response to epinephrine stimulus • tubulin deacetylation • rDNA heterochromatin assembly • phosphatidylinositol 3-kinase signaling • клітинний цикл • positive regulation of DNA binding • negative regulation of autophagy • cellular response to hypoxia • negative regulation of cell population proliferation • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • cellular lipid catabolic process • histone H3 deacetylation • peptidyl-lysine deacetylation • negative regulation of fat cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • substantia nigra development • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • negative regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • negative regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation • regulation of fat cell differentiation • transcription, DNA-templated • myelination in peripheral nervous system • histone H4 deacetylation • regulation of myelination • вроджений імунітет • hepatocyte growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of exit from mitosis • диференціація клітин • protein ADP-ribosylation • процес імунної системи • cellular response to hepatocyte growth factor stimulus • negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • regulation of phosphorylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • response to redox state • protein deacetylation • positive regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore • GO:0007126 мейоз • cellular response to caloric restriction • ripoptosome assembly involved in necroptotic process • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of defense response to bacterium • positive regulation of execution phase of apoptosis • protein kinase B signaling • negative regulation of striated muscle tissue development • positive regulation of oocyte maturation • regulation of cell cycle • поділ клітини • автофагія • positive regulation of meiotic nuclear division • cellular response to oxidative stress • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • histone deacetylation • positive regulation of cell division • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22933


64383

Ensembl


ENSG00000283100 ENSG00000068903


ENSMUSG00000015149

UniProt


Q8IXJ6


Q8VDQ8

RefSeq (мРНК)


NM_001193286 NM_012237 NM_030593


NM_001122765 NM_001122766 NM_022432

RefSeq (білок)


NP_001180215 NP_036369 NP_085096


NP_001116237 NP_001116238 NP_071877

Локус (UCSC)

Хр. 19: 38.88 – 38.9 Mb

Хр. 7: 28.47 – 28.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SIRT2 (англ. Sirtuin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 43 182^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEPDPSHPL	ETQAGKVQEA	QDSDSDSEGG	AAGGEADMDF	LRNLFSQTLS
LGSQKERLLD	ELTLEGVARY	MQSERCRRVI	CLVGAGISTS	AGIPDFRSPS
TGLYDNLEKY	HLPYPEAIFE	ISYFKKHPEP	FFALAKELYP	GQFKPTICHY
FMRLLKDKGL	LLRCYTQNID	TLERIAGLEQ	EDLVEAHGTF	YTSHCVSASC
RHEYPLSWMK	EKIFSEVTPK	CEDCQSLVKP	DIVFFGESLP	ARFFSCMQSD
FLKVDLLLVM	GTSLQVQPFA	SLISKAPLST	PRLLINKEKA	GQSDPFLGMI
MGLGGGMDFD	SKKAYRDVAW	LGECDQGCLA	LAELLGWKKE	LEDLVRREHA
SIDAQSGAGV	PNPSTSASPK	KSPPPAKDEA	RTTEREKPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, автофагія, диференціація клітин, нейрогенез, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках, хромосомах.

Література

Frye R.A. (1999). Characterization of five human cDNAs with homology to the yeast SIR2 gene: Sir2-like proteins (sirtuins) metabolize NAD and may have protein ADP-ribosyltransferase activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 273—279. PMID 10381378 DOI:10.1006/bbrc.1999.0897
Afshar G., Murnane J.P. (1999). Characterization of a human gene with sequence homology to Saccharomyces cerevisiae SIR2. Gene. 234: 161—168. PMID 10393250 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00162-6
Rack J.G., Vanlinden M.R., Lutter T., Aasland R., Ziegler M. (2014). Constitutive nuclear localization of an alternatively spliced sirtuin-2 isoform. J. Mol. Biol. 426: 1677—1691. PMID 24177535 DOI:10.1016/j.jmb.2013.10.027
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Grozinger C.M., Chao E.D., Blackwell H.E., Moazed D., Schreiber S.L. (2001). Identification of a class of small molecule inhibitors of the sirtuin family of NAD-dependent deacetylases by phenotypic screening. J. Biol. Chem. 276: 38837—38843. PMID 11483616 DOI:10.1074/jbc.M106779200
North B.J., Marshall B.L., Borra M.T., Denu J.M., Verdin E. (2003). The human Sir2 ortholog, SIRT2, is an NAD+-dependent tubulin deacetylase. Mol. Cell. 11: 437—444. PMID 12620231 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00038-8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10886 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IXJ6 (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.