SLITRK5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLITRK5, LRRC11, bA364G4.2, SLIT and NTRK like family member 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609680 MGI: 2679448 HomoloGene: 9193 GeneCards: SLITRK5 |
---|
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_015567 NM_001384609 NM_001384610 |
| | NM_029273 NM_198865 NM_001378768 NM_001378769 NM_001378770 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_942565 NP_001365697 NP_001365698 NP_001365699 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 87.67 – 87.7 Mb | Хр. 14: 111.91 – 111.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLITRK5 (англ. SLIT and NTRK like family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 958 амінокислот, а молекулярна маса — 107 486[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHTCCPPVTL | | EQDLHRKMHS | | WMLQTLAFAV | | TSLVLSCAET | | IDYYGEICDN |
ACPCEEKDGI | | LTVSCENRGI | | ISLSEISPPR | | FPIYHLLLSG | | NLLNRLYPNE |
FVNYTGASIL | | HLGSNVIQDI | | ETGAFHGLRG | | LRRLHLNNNK | | LELLRDDTFL |
GLENLEYLQV | | DYNYISVIEP | | NAFGKLHLLQ | | VLILNDNLLS | | SLPNNLFRFV |
PLTHLDLRGN | | RLKLLPYVGL | | LQHMDKVVEL | | QLEENPWNCS | | CELISLKDWL |
DSISYSALVG | | DVVCETPFRL | | HGRDLDEVSK | | QELCPRRLIS | | DYEMRPQTPL |
STTGYLHTTP | | ASVNSVATSS | | SAVYKPPLKP | | PKGTRQPNKP | | RVRPTSRQPS |
KDLGYSNYGP | | SIAYQTKSPV | | PLECPTACSC | | NLQISDLGLN | | VNCQERKIES |
IAELQPKPYN | | PKKMYLTENY | | IAVVRRTDFL | | EATGLDLLHL | | GNNRISMIQD |
RAFGDLTNLR | | RLYLNGNRIE | | RLSPELFYGL | | QSLQYLFLQY | | NLIREIQSGT |
FDPVPNLQLL | | FLNNNLLQAM | | PSGVFSGLTL | | LRLNLRSNHF | | TSLPVSGVLD |
QLKSLIQIDL | | HDNPWDCTCD | | IVGMKLWVEQ | | LKVGVLVDEV | | ICKAPKKFAE |
TDMRSIKSEL | | LCPDYSDVVV | | STPTPSSIQV | | PARTSAVTPA | | VRLNSTGAPA |
SLGAGGGASS | | VPLSVLILSL | | LLVFIMSVFV | | AAGLFVLVMK | | RRKKNQSDHT |
STNNSDVSSF | | NMQYSVYGGG | | GGTGGHPHAH | | VHHRGPALPK | | VKTPAGHVYE |
YIPHPLGHMC | | KNPIYRSREG | | NSVEDYKDLH | | ELKVTYSSNH | | HLQQQQQPPP |
PPQQPQQQPP | | PQLQLQPGEE | | ERRESHHLRS | | PAYSVSTIEP | | REDLLSPVQD |
ADRFYRGILE | | PDKHCSTTPA | | GNSLPEYPKF | | PCSPAAYTFS | | PNYDLRRPHQ |
YLHPGAGDSR | | LREPVLYSPP | | SAVFVEPNRN | | EYLELKAKLN | | VEPDYLEVLE |
KQTTFSQF |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue. Gene. 315: 87—94. PMID 14557068 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20295 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O94991 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |