SLMAP |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLMAP, SLAP, sarcolemma associated protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602701 MGI: 1933549 HomoloGene: 31428 GeneCards: SLMAP |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • smooth endoplasmic reticulum • цитоплазма • integral component of membrane • Сарколема • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • цитоскелет • мембрана • центр організації мікротрубочок |
---|
Біологічний процес | • м'язове скорочення • protein localization to plasma membrane • regulation of membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential • regulation of sodium ion transmembrane transport • regulation of voltage-gated sodium channel activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001304420 NM_001304421 NM_001304422 NM_001304423 NM_001311178
| NM_001311179 NM_007159 NM_001377538 NM_001377539 NM_001377540 NM_001377541 NM_001377542 NM_001377545 NM_001377549 NM_001377551 NM_001377552 NM_001377555 NM_001377557 NM_001377559 NM_001377562 NM_001377921 NM_001377922 NM_001377923 NM_001377924 NM_001377925 NM_001377926 NM_001377927 NM_001377928 |
| | NM_032008 NM_001310445 NM_001347494 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001291349 NP_001291350 NP_001291351 NP_001291352 NP_001298107
| NP_001298108 NP_009090 |
| | NP_001297374 NP_001334423 NP_114397 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 57.76 – 57.93 Mb | Хр. 14: 26.41 – 26.53 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLMAP (англ. Sarcolemma associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 95 198[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPSALAIFTC | | RPNSHPFQER | | HVYLDEPIKI | | GRSVARCRPA | | QNNATFDCKV |
LSRNHALVWF | | DHKTGKFYLQ | | DTKSSNGTFI | | NSQRLSRGSE | | ESPPCEILSG |
DIIQFGVDVT | | ENTRKVTHGC | | IVSTIKLFLP | | DGMEARLRSD | | VIHAPLPSPV |
DKVAANTPSM | | YSQELFQLSQ | | YLQEALHREQ | | MLEQKLATLQ | | RLLAITQEAS |
DTSWQALIDE | | DRLLSRLEVM | | GNQLQACSKN | | QTEDSLRKEL | | IALQEDKHNY |
ETTAKESLRR | | VLQEKIEVVR | | KLSEVERSLS | | NTEDECTHLK | | EMNERTQEEL |
RELANKYNGA | | VNEIKDLSDK | | LKVAEGKQEE | | IQQKGQAEKK | | ELQHKIDEME |
EKEQELQAKI | | EALQADNDFT | | NERLTALQVR | | LEHLQEKTLK | | ECSSLEHLLS |
KSGGDCTFIH | | QFIECQKKLI | | VEGHLTKAVE | | ETKLSKENQT | | RAKESDFSDT |
LSPSKEKSSD | | DTTDAQMDEQ | | DLNEPLAKVS | | LLKDDLQGAQ | | SEIEAKQEIQ |
HLRKELIEAQ | | ELARTSKQKC | | FELQALLEEE | | RKAYRNQVEE | | STKQIQVLQA |
QLQRLHIDTE | | NLREEKDSEI | | TSTRDELLSA | | RDEILLLHQA | | AAKVASERDT |
DIASLQEELK | | KVRAELERWR | | KAASEYEKEI | | TSLQNSFQLR | | CQQCEDQQRE |
EATRLQGELE | | KLRKEWNALE | | TECHSLKREN | | VLLSSELQRQ | | EKELHNSQKQ |
SLELTSDLSI | | LQMSRKELEN | | QVGSLKEQHL | | RDSADLKTLL | | SKAENQAKDV |
QKEYEKTQTV | | LSELKLKFEM | | TEQEKQSITD | | ELKQCKNNLK | | LLREKGNNKP |
WPWMPMLAAL | | VAVTAIVLYV | | PGLARASP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SLMAP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16643 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14BN4 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |