SNPH

Ідентифікатори

Символи

SNPH, bA314N13.5, syntaphilin

Зовнішні ІД

OMIM: 604942 MGI: 2139270 HomoloGene: 8817 GeneCards: SNPH

Онтологія гена
Молекулярна функція	• syntaxin-1 binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • neuron projection • cytoplasmic microtubule • міжклітинні контакти • neuronal cell body • клітинна мембрана • синапс • presynaptic membrane • мітохондріальна мембрана • мембрана
Біологічний процес	• brain development • synaptic vesicle docking • GO:0010554 neurotransmitter secretion • neuron differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9751


241727

Ensembl


ENSG00000101298


ENSMUSG00000027457

UniProt


O15079


Q80U23

RefSeq (мРНК)


NM_014723 NM_001318234


NM_001291076 NM_001291077 NM_198214

RefSeq (білок)


NP_001305163 NP_055538


NP_001278005 NP_001278006 NP_937857

Локус (UCSC)

Хр. 20: 1.27 – 1.31 Mb

Хр. 2: 151.59 – 151.63 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNPH (англ. Syntaphilin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 53 537^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAMSLPGSRR	TSAGSRRRTS	PPVSVRDAYG	TSSLSSSSNS	GSYKGSDSSP
TPRRSMKYTL	CSDNHGIKPP	TPEQYLTPLQ	QKEVCIRHLK	ARLKDTQDRL
QDRDTEIDDL	KTQLSRMQED	WIEEECHRVE	AQLALKEARK	EIKQLKQVID
TVKNNLIDKD	KGLQKYFVDI	NIQNKKLETL	LHSMEVAQNG	MAKEDGTGES
AGGSPARSLT	RSSTYTKLSD	PAVCGDRQPG	DPSSGSAEDG	ADSGFAAADD
TLSRTDALEA	SSLLSSGVDC	GTEETSLHSS	FGLGPRFPAS	NTYEKLLCGM
EAGVQASCMQ	ERAIQTDFVQ	YQPDLDTILE	KVTQAQVCGT	DPESGDRCPE
LDAHPSGPRD	PNSAVVVTVG	DELEAPEPIT	RGPTPQRPGA	NPNPGQSVSV
VCPMEEEEEA	AVAEKEPKSY	WSRHYIVDLL	AVVVPAVPTV	AWLCRSQRRQ
GQPIYNISSL	LRGCCTVALH	SIRRISCRSL	SQPSPSPAGG	GSQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15931 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O15079 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.