SNRPA1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNRPA1, Lea1, small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A', U2A' |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603521 MGI: 1916231 HomoloGene: 2325 GeneCards: SNRPA1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • U2 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • small nuclear ribonucleoprotein complex • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • nuclear speck • ядерні тільця • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome • Нуклеокапсид |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • interleukin-12-mediated signaling pathway • Сперматогенез |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 7: 65.71 – 65.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNRPA1 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A') – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 28 416[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVKLTAELIE | | QAAQYTNAVR | | DRELDLRGYK | | IPVIENLGAT | | LDQFDAIDFS |
DNEIRKLDGF | | PLLRRLKTLL | | VNNNRICRIG | | EGLDQALPCL | | TELILTNNSL |
VELGDLDPLA | | SLKSLTYLSI | | LRNPVTNKKH | | YRLYVIYKVP | | QVRVLDFQKV |
KLKERQEAEK | | MFKGKRGAQL | | AKDIARRSKT | | FNPGAGLPTD | | KKKGGPSPGD |
VEAIKNAIAN | | ASTLAEVERL | | KGLLQSGQIP | | GRERRSGPTD | | DGEEEMEEDT |
VTNGS |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Sillekens P.T.G., Beijer R.P., Habets W.J., van Venrooij W.J. (1989). Molecular cloning of the cDNA for the human U2 snRNA-specific A' protein. Nucleic Acids Res. 17: 1893—1906. PMID 2928112 DOI:10.1093/nar/17.5.1893
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
- Eldridge A.G., Li Y., Sharp P.A., Blencowe B.J. (1999). The SRm160/300 splicing coactivator is required for exon-enhancer function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 6125—6130. PMID 10339552 DOI:10.1073/pnas.96.11.6125
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Price S.R., Evans P.R., Nagai K. (1998). Crystal structure of the spliceosomal U2B'-U2A' protein complex bound to a fragment of U2 small nuclear RNA. Nature. 394: 645—650. PMID 9716128 DOI:10.1038/29234
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11152 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P09661 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |