SNRPB |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1D3B, 3CW1, 3PGW, 4PJO, 4WZJ, 3JCR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNRPB, COD, SNRPB1, Sm-B/B', SmB/B', SmB/SmB', snRNP-B, CCMS, small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 182282 MGI: 98342 HomoloGene: 134543 GeneCards: SNRPB |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
cerebro-costo-mandibular syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • histone pre-mRNA DCP binding • U2 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • telomerase RNA binding • RNA binding • U1 snRNP binding • U2 snRNP binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • catalytic step 2 spliceosome • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • histone pre-mRNA 3'end processing complex • U5 snRNP • U12-type spliceosomal complex • U2 snRNP • U1 snRNP • methylosome • U7 snRNP • small nuclear ribonucleoprotein complex • telomerase holoenzyme complex • spliceosomal complex • U4 snRNP • екзосома • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • spliceosomal snRNP assembly • Сплайсинг РНК • histone mRNA metabolic process • Метилювання білків • import into nucleus • brain development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 2.46 – 2.47 Mb | Хр. 2: 130.01 – 130.02 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNRPB (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 24 610[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTVGKSSKML | | QHIDYRMRCI | | LQDGRIFIGT | | FKAFDKHMNL | | ILCDCDEFRK |
IKPKNSKQAE | | REEKRVLGLV | | LLRGENLVSM | | TVEGPPPKDT | | GIARVPLAGA |
AGGPGIGRAA | | GRGIPAGVPM | | PQAPAGLAGP | | VRGVGGPSQQ | | VMTPQGRGTV |
AAAAAAATAS | | IAGAPTQYPP | | GRGGPPPPMG | | RGAPPPGMMG | | PPPGMRPPMG |
PPMGIPPGRG | | TPMGMPPPGM | | RPPPPGMRGP | | PPPGMRPPRP |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Schmauss C., McAllister G., Ohosone Y., Hardin J.A., Lerner M.R. (1989). A comparison of snRNP-associated Sm-autoantigens: human N, rat N and human B/B'. Nucleic Acids Res. 17: 1733—1743. PMID 2522186 DOI:10.1093/nar/17.4.1733
- Chu J.-L., Elkon K.B. (1991). The small nuclear ribonucleoproteins, SmB and B', are products of a single gene. Gene. 97: 311—312. PMID 1825643 DOI:10.1016/0378-1119(91)90069-N
- Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
- Narayanan U., Ospina J.K., Frey M.R., Hebert M.D., Matera A.G. (2002). SMN, the spinal muscular atrophy protein, forms a pre-import snRNP complex with snurportin1 and importin beta. Hum. Mol. Genet. 11: 1785—1795. PMID 12095920 DOI:10.1093/hmg/11.15.1785
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Cote J., Richard S. (2005). Tudor domains bind symmetrical dimethylated arginines. J. Biol. Chem. 280: 28476—28483. PMID 15955813 DOI:10.1074/jbc.M414328200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SNRPB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11153 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P14678 (англ.) . Архів оригіналу за 7 березня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |