SNTA1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5e/Protein_SNTA1_PDB_1qav.png/250px-Protein_SNTA1_PDB_1qav.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1QAV, 1Z86, 1Z87, 2ADZ, 2PDZ, 4HOP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNTA1, LQT12, SNT1, TACIP1, dJ1187J4.5, Syntrophin, alpha 1, syntrophin alpha 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601017 MGI: 101772 HomoloGene: 2331 GeneCards: SNTA1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
long QT syndrome 12[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • sodium channel regulator activity • nitric-oxide synthase binding • transmembrane transporter binding • ATPase binding • structural molecule activity • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • PDZ domain binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • lateral plasma membrane • мембрана • neuromuscular junction • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • міжклітинні контакти • Сарколема • syntrophin complex • цитоскелет • GO:0009327 protein-containing complex • dystrophin-associated glycoprotein complex • синапс |
---|
Біологічний процес | • м'язове скорочення • negative regulation of peptidyl-cysteine S-nitrosylation • ventricular cardiac muscle cell action potential • регуляція серцевого ритму • regulation of sodium ion transmembrane transport • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5d/PBB_GE_SNTA1_203516_at_fs.png/250px-PBB_GE_SNTA1_203516_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 33.41 – 33.44 Mb | Хр. 2: 154.22 – 154.25 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNTA1 (англ. Syntrophin alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот, а молекулярна маса — 53 895[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASGRRAPRT | | GLLELRAGAG | | SGAGGERWQR | | VLLSLAEDVL | | TVSPADGDPG |
PEPGAPREQE | | PAQLNGAAEP | | GAGPPQLPEA | | LLLQRRRVTV | | RKADAGGLGI |
SIKGGRENKM | | PILISKIFKG | | LAADQTEALF | | VGDAILSVNG | | EDLSSATHDE |
AVQVLKKTGK | | EVVLEVKYMK | | DVSPYFKNST | | GGTSVGWDSP | | PASPLQRQPS |
SPGPTPRNFS | | EAKHMSLKMA | | YVSKRCTPND | | PEPRYLEICS | | ADGQDTLFLR |
AKDEASARSW | | ATAIQAQVNT | | LTPRVKDELQ | | ALLAATSTAG | | SQDIKQIGWL |
TEQLPSGGTA | | PTLALLTEKE | | LLLYLSLPET | | REALSRPART | | APLIATRLVH |
SGPSKGSVPY | | DAELSFALRT | | GTRHGVDTHL | | FSVESPQELA | | AWTRQLVDGC |
HRAAEGVQEV | | STACTWNGRP | | CSLSVHIDKG | | FTLWAAEPGA | | ARAVLLRQPF |
EKLQMSSDDG | | ASLLFLDFGG | | AEGEIQLDLH | | SCPKTIVFII | | HSFLSAKVTR |
LGLLA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Castello A., Brocheriou V., Chafey P., Kahn A., Gilgenkrantz H. (1996). Characterization of the dystrophin-syntrophin interaction using the two-hybrid system in yeast. FEBS Lett. 383: 124—128. PMID 8612778 DOI:10.1016/0014-5793(96)00214-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fernandez-Larrea J., Merlos-Suarez A., Urena J.M., Baselga J., Arribas J. (1999). A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF-alpha to the cell surface. Mol. Cell. 3: 423—433. PMID 10230395 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80470-0
- Olalla L., Aledo J.C., Bannenberg G., Marquez J. (2001). The C-terminus of human glutaminase L mediates association with PDZ domain-containing proteins. FEBS Lett. 488: 116—122. PMID 11163757 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02373-5
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SNTA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11167 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13424 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |