SNX2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNX2, TRG-9, sorting nexin 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605929 MGI: 1915054 HomoloGene: 2332 GeneCards: SNX2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • insulin receptor binding • leptin receptor binding • epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • protein heterodimerization activity • transferrin receptor binding • lipid binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • cell projection • early endosome membrane • мембрана • retromer, tubulation complex • retromer complex • endosome membrane • lamellipodium • extrinsic component of membrane • гіалоплазма • лізосома • ендосома • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • ендоцитоз • vesicle organization • early endosome to Golgi transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein complex oligomerization • protein transport • intracellular protein transport • lamellipodium morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 122.78 – 122.83 Mb | Хр. 18: 53.31 – 53.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNX2 (англ. Sorting nexin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 58 471[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAEREPPPL | | GDGKPTDFED | | LEDGEDLFTS | | TVSTLESSPS | | SPEPASLPAE |
DISANSNGPK | | PTEVVLDDDR | | EDLFAEATEE | | VSLDSPEREP | | ILSSEPSPAV |
TPVTPTTLIA | | PRIESKSMSA | | PVIFDRSREE | | IEEEANGDIF | | DIEIGVSDPE |
KVGDGMNAYM | | AYRVTTKTSL | | SMFSKSEFSV | | KRRFSDFLGL | | HSKLASKYLH |
VGYIVPPAPE | | KSIVGMTKVK | | VGKEDSSSTE | | FVEKRRAALE | | RYLQRTVKHP |
TLLQDPDLRQ | | FLESSELPRA | | VNTQALSGAG | | ILRMVNKAAD | | AVNKMTIKMN |
ESDAWFEEKQ | | QQFENLDQQL | | RKLHVSVEAL | | VCHRKELSAN | | TAAFAKSAAM |
LGNSEDHTAL | | SRALSQLAEV | | EEKIDQLHQE | | QAFADFYMFS | | ELLSDYIRLI |
AAVKGVFDHR | | MKCWQKWEDA | | QITLLKKREA | | EAKMMVANKP | | DKIQQAKNEI |
REWEAKVQQG | | ERDFEQISKT | | IRKEVGRFEK | | ERVKDFKTVI | | IKYLESLVQT |
QQQLIKYWEA | | FLPEAKAIA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, клітинних відростках, ендосомах.
Література
- Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fuchs U., Rehkamp G.F., Slany R., Follo M., Borkhardt A. (2003). The formin-binding protein 17, FBP17, binds via a TNKS binding motif to tankyrase, a protein involved in telomere maintenance. FEBS Lett. 554: 10—16. PMID 14596906 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01063-9
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Rojas R., Kametaka S., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2007). Interchangeable but essential functions of SNX1 and SNX2 in the association of retromer with endosomes and the trafficking of mannose 6-phosphate receptors. Mol. Cell. Biol. 27: 1112—1124. PMID 17101778 DOI:10.1128/MCB.00156-06
- Lieu Z.Z., Gleeson P.A. (2010). Identification of different itineraries and retromer components for endosome-to-Golgi transport of TGN38 and Shiga toxin. Eur. J. Cell Biol. 89: 379—393. PMID 20138391 DOI:10.1016/j.ejcb.2009.10.021
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11173 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O60749 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |