SOGA1

Ідентифікатори

Символи

SOGA1, C20orf117, KIAA0889, SOGA, suppressor of glucose, autophagy associated 1

Зовнішні ІД

MGI: 2444575 HomoloGene: 52382 GeneCards: SOGA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• молекулярна функція
Клітинна компонента	• extracellular region • екзосома • міжклітинний простір
Біологічний процес	• negative regulation of gluconeogenesis • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • regulation of autophagy
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


140710


320706

Ensembl


ENSG00000149639


ENSMUSG00000055485

UniProt


O94964


E1U8D0 A2ACV6

RefSeq (мРНК)


NM_199181 NM_080627 NM_152257


NM_001164663

RefSeq (білок)


NP_542194 NP_954650


NP_001158135

Локус (UCSC)

Хр. 20: 36.78 – 36.86 Mb

Хр. 2: 156.86 – 156.92 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SOGA1 (англ. Suppressor of glucose, autophagy associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 423 амінокислот, а молекулярна маса — 159 760^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLEMRDVYME	EDVYQLQELR	QQLDQASKTC	RILQYRLRKA	ERRSLRAAQT
GQVDGELIRG	LEQDVKVSKD	ISMRLHKELE	VVEKKRARLE	EENEELRQRL
IETELAKQVL	QTELERPREH	SLKKRGTRSL	GKADKKTLVQ	EDSADLKCQL
HFAKEESALM	CKKLTKLAKE	NDSMKEELLK	YRSLYGDLDS	ALSAEELADA
PHSRETELKV	HLKLVEEEAN	LLSRRIVELE	VENRGLRAEM	DDMKDHGGGC
GGPEARLAFS	ALGGGECGES	LAELRRHLQF	VEEEAELLRR	SSAELEDQNK
LLLNELAKFR	SEHELDVALS	EDSCSVLSEP	SQEELAAAKL	QIGELSGKVK
KLQYENRVLL	SNLQRCDLAS	CQSTRPMLET	DAEAGDSAQC	VPAPLGETHE
SHAVRLCRAR	EAEVLPGLRE	QAALVSKAID	VLVADANGFT	AGLRLCLDNE
CADFRLHEAP	DNSEGPRDTK	LIHAILVRLS	VLQQELNAFT	RKADAVLGCS
VKEQQESFSS	LPPLGSQGLS	KEILLAKDLG	SDFQPPDFRD	LPEWEPRIRE
AFRTGDLDSK	PDPSRSFRPY	RAEDNDSYAS	EIKELQLVLA	EAHDSLRGLQ
EQLSQERQLR	KEEADNFNQK	MVQLKEDQQR	ALLRREFELQ	SLSLQRRLEQ
KFWSQEKNML	VQESQQFKHN	FLLLFMKLRW	FLKRWRQGKV	LPSEGDDFLE
VNSMKELYLL	MEEEEINAQH	SDNKACTGDS	WTQNTPNEYI	KTLADMKVTL
KELCWLLRDE	RRGLTELQQQ	FAKAKATWET	ERAELKGHTS	QMELKTGKGA
GERAGPDWKA	ALQREREEQQ	HLLAESYSAV	MELTRQLQIS	ERNWSQEKLQ
LVERLQGEKQ	QVEQQVKELQ	NRLSQLQKAA	DPWVLKHSEL	EKQDNSWKET
RSEKIHDKEA	VSEVELGGNG	LKRTKSVSSM	SEFESLLDCS	PYLAGGDARG
KKLPNNPAFG	FVSSEPGDPE	KDTKEKPGLS	SRDCNHLGAL	ACQDPPGRQM
QRSYTAPDKT	GIRVYYSPPV	ARRLGVPVVH	DKEGKIIIEP	GFLFTTAKPK
ESAEADGLAE	SSYGRWLCNF	SRQRLDGGSA	GSPSAAGPGF	PAALHDFEMS
GNMSDDMKEI	TNCVRQAMRS	GSLERKVKST	SSQTVGLASV	GTQTIRTVSV
GLQTDPPRSS	LHGKAWSPRS	SSLVSVRSKQ	ISSSLDKVHS	RIERPCCSPK
YGSPKLQRRS	VSKLDSSKDR	SLWNLHQGKQ	NGSAWARSTT	TRDSPVLRNI
NDGLSSLFSV	VEHSGSTESV	WKLGMSETRA	KPEPPKYGIV	QEFFRNVCGR
APSPTSSAGE	EGTKKPEPLS	PASYHQPEGV	ARILNKKAAK	LGSSEEVRLT
MLPQVGKDGV	LRDGDGAVVL	PNEDAVCDCS	TQSLTSCFAR	SSRSAIRHSP
SKCRLHPSES	SWGGEERALP	PSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16111 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O94964 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.