SREK1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SREK1, SFRS12, SRrp508, SRrp86, splicing regulatory glutamic acid/lysine-rich protein 1, splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609268 MGI: 2145245 HomoloGene: 10581 GeneCards: SREK1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • Сплайсинг РНК • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001077199 NM_001270492 NM_001270493 NM_139168 NM_001323527
| NM_001323529 NM_001323533 NM_001323534 NM_001323535 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001070667 NP_001257421 NP_001310456 NP_001310458 NP_001310462
| NP_001310463 NP_001310464 NP_631907 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 66.14 – 66.18 Mb | Хр. 13: 103.88 – 103.91 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SREK1 (англ. Splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 59 380[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTSLMPGAGL | | LPIPTPNPLT | | TLGVSLSSLG | | AIPAAALDPN | | IATLGEIPQP |
PLMGNVDPSK | | IDEIRRTVYV | | GNLNSQTTTA | | DQLLEFFKQV | | GEVKFVRMAG |
DETQPTRFAF | | VEFADQNSVP | | RALAFNGVMF | | GDRPLKINHS | | NNAIVKPPEM |
TPQAAAKELE | | EVMKRVREAQ | | SFISAAIEPE | | SGKSNERKGG | | RSRSHTRSKS |
RSSSKSHSRR | | KRSQSKHRSR | | SHNRSRSRQK | | DRRRSKSPHK | | KRSKSRERRK |
SRSRSHSRDK | | RKDTREKIKE | | KERVKEKDRE | | KEREREKERE | | KEKERGKNKD |
RDKEREKDRE | | KDKEKDRERE | | REKEHEKDRD | | KEKEKEQDKE | | KEREKDRSKE |
IDEKRKKDKK | | SRTPPRSYNA | | SRRSRSSSRE | | RRRRRSRSSS | | RSPRTSKTIK |
RKSSRSPSPR | | SRNKKDKKRE | | KERDHISERR | | ERERSTSMRK | | SSNDRDGKEK |
LEKNSTSLKE | | KEHNKEPDSS | | VSKEVDDKDA | | PRTEENKIQH | | NGNCQLNEEN |
LSTKTEAV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902
- Zhang D.L., Sun X.J., Ling L.J., Chen R.S., Ma D.L. (2002). Molecular cloning, characterization, chromosomal assignment, genomic organization and verification of SFRS12(SRrp508), a novel member of human SR protein superfamily and a human homolog of rat SRrp86. Yi Chuan Xue Bao. 29: 377—383. PMID 12043562
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17882 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8WXA9 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |