SRPK2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2X7G

Ідентифікатори

Символи

SRPK2, SFRSK2, SRSF protein kinase 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602980 MGI: 1201408 HomoloGene: 101663 GeneCards: SRPK2

Пов'язані генетичні захворювання

короткозорість^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • 14-3-3 protein binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • magnesium ion binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0007243 intracellular signal transduction • nuclear speck organization • фосфорилювання • mRNA processing • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • protein phosphorylation • spliceosomal complex assembly • positive regulation of neuron apoptotic process • negative regulation of viral genome replication • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of cell cycle • Ангіогенез • Сплайсинг РНК • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of viral genome replication • вроджений імунітет • регуляція експресії генів • regulation of mRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6733


20817

Ensembl


ENSG00000135250


ENSMUSG00000062604

UniProt


P78362


O54781

RefSeq (мРНК)

NM_001278273 NM_182691 NM_182692 NM_001350738 NM_001350739
NM_001350740 NM_001350741 NM_001350742 NM_001350743 NM_001350744 NM_001350745 NM_001350746

NM_009274 NM_001359172 NM_001359173 NM_001359174 NM_001359175
NM_001359176

RefSeq (білок)

NP_001265202 NP_872633 NP_872634 NP_001337667 NP_001337668
NP_001337669 NP_001337670 NP_001337671 NP_001337672 NP_001337673 NP_001337674 NP_001337675

NP_033300 NP_001346101 NP_001346102 NP_001346103 NP_001346104
NP_001346105 NP_001394425 NP_001394427 NP_001394428 NP_001394429 NP_001394430 NP_001394431 NP_001394432 NP_001394433 NP_001394434 NP_001394435 NP_001394436 NP_001394437 NP_001394438 NP_001394439 NP_001394440 NP_001394441 NP_001394442 NP_001394443 NP_001394444 NP_001394445 NP_001394446 NP_001394447 NP_001394448 NP_001394449 NP_001394450 NP_001394451 NP_001394452

Локус (UCSC)

Хр. 7: 105.11 – 105.4 Mb

Хр. 5: 23.5 – 23.68 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRPK2 (англ. SRSF protein kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 688 амінокислот, а молекулярна маса — 77 527^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVNSEKSSS	SERPEPQQKA	PLVPPPPPPP	PPPPPPLPDP	TPPEPEEEIL
GSDDEEQEDP	ADYCKGGYHP	VKIGDLFNGR	YHVIRKLGWG	HFSTVWLCWD
MQGKRFVAMK	VVKSAQHYTE	TALDEIKLLK	CVRESDPSDP	NKDMVVQLID
DFKISGMNGI	HVCMVFEVLG	HHLLKWIIKS	NYQGLPVRCV	KSIIRQVLQG
LDYLHSKCKI	IHTDIKPENI	LMCVDDAYVR	RMAAEATEWQ	KAGAPPPSGS
AVSTAPQQKP	IGKISKNKKK	KLKKKQKRQA	ELLEKRLQEI	EELEREAERK
IIEENITSAA	PSNDQDGEYC	PEVKLKTTGL	EEAAEAETAK	DNGEAEDQEE
KEDAEKENIE	KDEDDVDQEL	ANIDPTWIES	PKTNGHIENG	PFSLEQQLDD
EDDDEEDCPN	PEEYNLDEPN	AESDYTYSSS	YEQFNGELPN	GRHKIPESQF
PEFSTSLFSG	SLEPVACGSV	LSEGSPLTEQ	EESSPSHDRS	RTVSASSTGD
LPKAKTRAAD	LLVNPLDPRN	ADKIRVKIAD	LGNACWVHKH	FTEDIQTRQY
RSIEVLIGAG	YSTPADIWST	ACMAFELATG	DYLFEPHSGE	DYSRDEDHIA
HIIELLGSIP	RHFALSGKYS	REFFNRRGEL	RHITKLKPWS	LFDVLVEKYG
WPHEDAAQFT	DFLIPMLEMV	PEKRASAGEC	LRHPWLNS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zheng Y., Fu X.D., Ou J.H. (2005). Suppression of hepatitis B virus replication by SRPK1 and SRPK2 via a pathway independent of the phosphorylation of the viral core protein. Virology. 342: 150—158. PMID 16122776 DOI:10.1016/j.virol.2005.07.030
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Giannakouros T., Nikolakaki E., Mylonis I., Georgatsou E. (2011). Serine-arginine protein kinases: a small protein kinase family with a large cellular presence. FEBS J. 278: 570—586. PMID 21205200 DOI:10.1111/j.1742-4658.2010.07987.x
Hong Y., Jang S.W., Ye K. (2011). The N-terminal fragment from caspase-cleaved serine/arginine protein-specific kinase2 (SRPK2) translocates into the nucleus and promotes apoptosis. J. Biol. Chem. 286: 777—786. PMID 21056976 DOI:10.1074/jbc.M110.193441

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SRPK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11306 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P78362 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.