SRSF4

Ідентифікатори

Символи

SRSF4, SFRS4, SRP75, serine/arginine-rich splicing factor 4, serine and arginine rich splicing factor 4

Зовнішні ІД

OMIM: 601940 MGI: 1890577 HomoloGene: 25624 GeneCards: SRSF4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific mRNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleotide binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus • response to insulin • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6429


57317

Ensembl


ENSG00000116350


ENSMUSG00000028911

UniProt


Q08170


Q8VE97

RefSeq (мРНК)


NM_005626


NM_020587

RefSeq (білок)


NP_005617


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 29.15 – 29.18 Mb

Хр. 4: 131.87 – 131.9 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRSF4 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 56 678^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRVYIGRLS	YQARERDVER	FFKGYGKILE	VDLKNGYGFV	EFDDLRDADD
AVYELNGKDL	CGERVIVEHA	RGPRRDGSYG	SGRSGYGYRR	SGRDKYGPPT
RTEYRLIVEN	LSSRCSWQDL	KDYMRQAGEV	TYADAHKGRK	NEGVIEFVSY
SDMKRALEKL	DGTEVNGRKI	RLVEDKPGSR	RRRSYSRSRS	HSRSRSRSRH
SRKSRSRSGS	SKSSHSKSRS	RSRSGSRSRS	KSRSRSQSRS	RSKKEKSRSP
SKEKSRSRSH	SAGKSRSKSK	DQAEEKIQNN	DNVGKPKSRS	PSRHKSKSKS
RSRSQERRVE	EEKRGSVSRG	RSQEKSLRQS	RSRSRSKGGS	RSRSRSRSKS
KDKRKGRKRS	REESRSRSRS	RSKSERSRKR	GSKRDSKAGS	SKKKKKEDTD
RSQSRSPSRS	VSKEREHAKS	ESSQREGRGE	SENAGTNQET	RSRSRSNSKS
KPNLPSESRS	RSKSASKTRS	RSKSRSRSAS	RSPSRSRSRS	HSRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Zahler A.M., Neugebauer K.M., Stolk J.A., Roth M.B. (1993). Human SR proteins and isolation of a cDNA encoding SRp75. Mol. Cell. Biol. 13: 4023—4028. PMID 8321209 DOI:10.1128/MCB.13.7.4023
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10786 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q08170 (англ.) . Архів оригіналу за 8 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.