SSX2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SSX2

SSX2B

Ідентифікатори

Символи

SSX2B, CT5.2, CT5.2b, HOM-MEL-40, SSX, synovial sarcoma, X breakpoint 2B, SSX family member 2B

Зовнішні ІД

HomoloGene: 133226 GeneCards: SSX2B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


727837


н/д

Ensembl


ENSG00000268447


н/д

UniProt


Q16385


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001278702 NM_001164417 NM_001278701


н/д

RefSeq (білок)


NP_001157889 NP_001265630 NP_001265631


н/д

Локус (UCSC)

Хр. X: 52.75 – 52.79 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

SSX2 (англ. SSX family member 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 188 амінокислот, а молекулярна маса — 21 620^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGDDAFARR	PTVGAQIPEK	IQKAFDDIAK	YFSKEEWEKM	KASEKIFYVY
MKRKYEAMTK	LGFKATLPPF	MCNKRAEDFQ	GNDLDNDPNR	GNQVERPQMT
FGRLQGISPK	IMPKKPAEEG	NDSEEVPEAS	GPQNDGKELC	PPGKPTTSEK
IHERSGPKRG	EHAWTHRLRE	RKQLVIYEEI	SDPEEDDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
de Leeuw B., Balemans M., Olde Weghuis D., Geurts van Kessel A. (1995). Identification of two alternative fusion genes, SYT-SSX1 and SYT-SSX2, in t(X;18)(p11.2;q11.2)-positive synovial sarcomas. Hum. Mol. Genet. 4: 1097—1099. PMID 7655467 DOI:10.1093/hmg/4.6.1097

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11336 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16385 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.