STAG1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | STAG1, SA1, SCC3A, stromal antigen 1, MRD47 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604358 MGI: 1098658 HomoloGene: 21191 GeneCards: STAG1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal dominant mental retardation 47[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • хромосома • гіалоплазма • Хроматин • центромера • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • GO:0000798 cohesin complex • nuclear matrix • mitotic spindle pole |
---|
Біологічний процес | • chromosome segregation • поділ клітини • клітинний цикл • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of mitotic spindle assembly • sister chromatid cohesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_009282 NM_001357264 NM_001357265 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_033308 NP_001344193 NP_001344194 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 136.34 – 136.75 Mb | Хр. 9: 100.48 – 100.84 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
STAG1 (англ. Stromal antigen 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 258 амінокислот, а молекулярна маса — 144 427[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MITSELPVLQ | | DSTNETTAHS | | DAGSELEETE | | VKGKRKRGRP | | GRPPSTNKKP |
RKSPGEKSRI | | EAGIRGAGRG | | RANGHPQQNG | | EGEPVTLFEV | | VKLGKSAMQS |
VVDDWIESYK | | QDRDIALLDL | | INFFIQCSGC | | RGTVRIEMFR | | NMQNAEIIRK |
MTEEFDEDSG | | DYPLTMPGPQ | | WKKFRSNFCE | | FIGVLIRQCQ | | YSIIYDEYMM |
DTVISLLTGL | | SDSQVRAFRH | | TSTLAAMKLM | | TALVNVALNL | | SIHQDNTQRQ |
YEAERNKMIG | | KRANERLELL | | LQKRKELQEN | | QDEIENMMNS | | IFKGIFVHRY |
RDAIAEIRAI | | CIEEIGVWMK | | MYSDAFLNDS | | YLKYVGWTLH | | DRQGEVRLKC |
LKALQSLYTN | | RELFPKLELF | | TNRFKDRIVS | | MTLDKEYDVA | | VEAIRLVTLI |
LHGSEEALSN | | EDCENVYHLV | | YSAHRPVAVA | | AGEFLHKKLF | | SRHDPQAEEA |
LAKRRGRNSP | | NGNLIRMLVL | | FFLESELHEH | | AAYLVDSLWE | | SSQELLKDWE |
CMTELLLEEP | | VQGEEAMSDR | | QESALIELMV | | CTIRQAAEAH | | PPVGRGTGKR |
VLTAKERKTQ | | IDDRNKLTEH | | FIITLPMLLS | | KYSADAEKVA | | NLLQIPQYFD |
LEIYSTGRME | | KHLDALLKQI | | KFVVEKHVES | | DVLEACSKTY | | SILCSEEYTI |
QNRVDIARSQ | | LIDEFVDRFN | | HSVEDLLQEG | | EEADDDDIYN | | VLSTLKRLTS |
FHNAHDLTKW | | DLFGNCYRLL | | KTGIEHGAMP | | EQIVVQALQC | | SHYSILWQLV |
KITDGSPSKE | | DLLVLRKTVK | | SFLAVCQQCL | | SNVNTPVKEQ | | AFMLLCDLLM |
IFSHQLMTGG | | REGLQPLVFN | | PDTGLQSELL | | SFVMDHVFID | | QDEENQSMEG |
DEEDEANKIE | | ALHKRRNLLA | | AFSKLIIYDI | | VDMHAAADIF | | KHYMKYYNDY |
GDIIKETLSK | | TRQIDKIQCA | | KTLILSLQQL | | FNELVQEQGP | | NLDRTSAHVS |
GIKELARRFA | | LTFGLDQIKT | | REAVATLHKD | | GIEFAFKYQN | | QKGQEYPPPN |
LAFLEVLSEF | | SSKLLRQDKK | | TVHSYLEKFL | | TEQMMERRED | | VWLPLISYRN |
SLVTGGEDDR | | MSVNSGSSSS | | KTSSVRNKKG | | RPPLHKKRVE | | DESLDNTWLN |
RTDTMIQTPG | | PLPAPQLTST | | VLRENSRPMG | | DQIQEPESEH | | GSEPDFLHNP |
QMQISWLGQP | | KLEDLNRKDR | | TGMNYMKVRT | | GVRHAVRGLM | | EEDAEPIFED |
VMMSSRSQLE | | DMNEEFEDTM | | VIDLPPSRNR | | RERAELRPDF | | FDSAAIIEDD |
SGFGMPMF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, розходження хромосом, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sumara I., Vorlaufer E., Gieffers C., Peters B.H., Peters J.-M. (2000). Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase. J. Cell Biol. 151: 749—762. PMID 11076961 DOI:10.1083/jcb.151.4.749
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з STAG1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11354 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8WVM7 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |