STRN

Ідентифікатори

Символи

STRN, SG2NA, PPP2R6A, striatin, STRN1

Зовнішні ІД

OMIM: 614765 MGI: 1333757 HomoloGene: 2380 GeneCards: STRN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein phosphatase 2A binding • estrogen receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • armadillo repeat domain binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • neuronal cell body • postsynaptic membrane • dendritic spine • protein phosphatase type 2A complex • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • bicellular tight junction • дендрит (нейробіологія) • FAR/SIN/STRIPAK complex
Біологічний процес	• dendrite development • Wnt signaling pathway • locomotory behavior • negative regulation of cell population proliferation • bicellular tight junction assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6801


268980

Ensembl


ENSG00000115808


ENSMUSG00000024077

UniProt


O43815


O55106

RefSeq (мРНК)


NM_003162


NM_011500

RefSeq (білок)


NP_003153


NP_035630

Локус (UCSC)

Хр. 2: 36.84 – 36.97 Mb

Хр. 17: 78.96 – 79.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STRN (англ. Striatin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 780 амінокислот, а молекулярна маса — 86 132^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEQAGPGVF	FSNNHPGAGG	AKGLGPLAEA	AAAGDGAAAA	GAARAQYSLP
GILHFLQHEW	ARFEVERAQW	EVERAELQAQ	IAFLQGERKG	QENLKKDLVR
RIKMLEYALK	QERAKYHKLK	YGTELNQGDM	KPPSYDSDEG	NETEVQPQQN
SQLMWKQGRQ	LLRQYLQEVG	YTDTILDVKS	KRVRALLGFS	SDVTDREDDK
NQDSVVNGTE	AEVKETAMIA	KSELTDSASV	LDNFKFLESA	AADFSDEDED
DDVDGREKSV	IDTSTIVRKK	ALPDSGEDRD	TKEALKEFDF	LVTSEEGDNE
SRSAGDGTDW	EKEDQCLMPE	AWNVDQGVIT	KLKEQYKKER	KGKKGVKRPN
RSKLQDMLAN	LRDVDELPSL	QPSVGSPSRP	SSSRLPEHEI	NRADEVEALT
FPPSSGKSFI	MGADEALESE	LGLGELAGLT	VANEADSLTY	DIANNKDALR
KTWNPKFTLR	SHFDGIRALA	FHPIEPVLIT	ASEDHTLKMW	NLQKTAPAKK
STSLDVEPIY	TFRAHKGPVL	CVVMSSNGEQ	CYSGGTDGLI	QGWNTTNPNI
DPYDSYDPSV	LRGPLLGHTD	AVWGLAYSAA	HQRLLSCSAD	GTLRLWNTTE
VAPALSVFND	TKELGIPASV	DLVSSDPSHM	VASFSKGYTS	IFNMETQQRI
LTLESNVDTT	ANSSCQINRV	ISHPTLPISI	TAHEDRHIKF	YDNNTGKLIH
SMVAHLEAVT	SLAVDPNGLY	LMSGSHDCSI	RLWNLESKTC	IQEFTAHRKK
FEESIHDVAF	HPSKCYIASA	GADALAKVFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11424 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43815 (англ.) . Архів оригіналу за 29 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.