STRN3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | STRN3, SG2NA, PPP2R6B, striatin 3, S/G2NA |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614766 MGI: 2151064 HomoloGene: 82078 GeneCards: STRN3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein phosphatase 2A binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • armadillo repeat domain binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • neuronal cell body • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • дендрит (нейробіологія) • protein phosphatase type 2A complex • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • FAR/SIN/STRIPAK complex |
---|
Біологічний процес | • response to estradiol • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001172098 NM_052973 NM_001364437 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001165569 NP_443205 NP_001351366 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 30.89 – 31.03 Mb | Хр. 12: 51.66 – 51.74 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
STRN3 (англ. Striatin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 87 209[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDELAGGGGG | | GPGMAAPPRQ | | QQGPGGNLGL | | SPGGNGAAGG | | GGPPASEGAG |
PAAGPELSRP | | QQYTIPGILH | | YIQHEWARFE | | MERAHWEVER | | AELQARIAFL |
QGERKGQENL | | KKDLVRRIKM | | LEYALKQERA | | KYHKLKYGTE | | LNQGDLKMPT |
FESEETKDTE | | APTAPQNSQL | | TWKQGRQLLR | | QYLQEVGYTD | | TILDVRSQRV |
RSLLGLSNSE | | PNGSVETKNL | | EQILNGGESP | | KQKGQEIKRS | | SGDVLETFNF |
LENADDSDED | | EENDMIEGIP | | EGKDKHRMNK | | HKIGNEGLAA | | DLTDDPDTEE |
ALKEFDFLVT | | AEDGEGAGEA | | RSSGDGTEWD | | KDDLSPTAEV | | WDVDQGLISK |
LKEQYKKERK | | GKKGVKRANR | | TKLYDMIADL | | GDDELPHIPS | | GIINQSRSAS |
TRMTDHEGAR | | AEEAEPITFP | | SGGGKSFIMG | | SDDVLLSVLG | | LGDLADLTVT |
NDADYSYDLP | | ANKDAFRKTW | | NPKYTLRSHF | | DGVRALAFHP | | VEPVLVTASE |
DHTLKLWNLQ | | KTVPAKKSAS | | LDVEPIYTFR | | AHIGPVLSLA | | ISSNGEQCFS |
GGIDATIQWW | | NMPSPSVDPY | | DTYEPNVLAG | | TLVGHTDAVW | | GLAYSGIKNQ |
LLSCSADGTV | | RLWNPQEKLP | | CICTYNGDKK | | HGIPTSVDFI | | GCDPAHMVTS |
FNTGSAVIYD | | LETSQSLVIL | | SSQVDSGLQS | | NNHINRVVSH | | PTLPVTITAH |
EDRHIKFFDN | | KTGKMIHSMV | | AHLDAVTSLA | | VDPNGIYLMS | | GSHDCSIRLW |
NLDSKTCVQE | | ITAHRKKLDE | | SIYDVAFHSS | | KAYIASAGAD | | ALAKVFV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- Muro Y., Chan E.K., Landberg G., Tan E.M. (1995). A cell-cycle nuclear autoantigen containing WD-40 motifs expressed mainly in S and G2 phase cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 207: 1029—1037. PMID 7864889 DOI:10.1006/bbrc.1995.1288
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15720 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q13033 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |