STX17 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4WY4,%%s4WY4 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | STX17, syntaxin 17 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604204 MGI: 1914977 HomoloGene: 9917 GeneCards: STX17 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
alopecia areata[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase binding • protein kinase binding • SNARE binding |
---|
Клітинна компонента | • HOPS complex • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane • rough endoplasmic reticulum • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • lysosomal membrane • autophagosome membrane • SNARE complex • smooth endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • ER to Golgi transport vesicle membrane • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • autophagosome • клітинна мембрана • система ендомембран |
---|
Біологічний процес | • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment organization • Golgi organization • protein localization to phagophore assembly site • автофагія • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • vesicle docking • GO:0000046 autophagosome maturation • intracellular protein transport • vesicle fusion • vesicle-mediated transport • autophagosome membrane docking • екзоцитоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 99.91 – 99.97 Mb | Хр. 4: 48.12 – 48.19 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
STX17 (англ. Syntaxin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 302 амінокислот, а молекулярна маса — 33 403[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSEDEEKVKL | | RRLEPAIQKF | | IKIVIPTDLE | | RLRKHQINIE | | KYQRCRIWDK |
LHEEHINAGR | | TVQQLRSNIR | | EIEKLCLKVR | | KDDLVLLKRM | | IDPVKEEASA |
ATAEFLQLHL | | ESVEELKKQF | | NDEETLLQPP | | LTRSMTVGGA | | FHTTEAEASS |
QSLTQIYALP | | EIPQDQNAAE | | SWETLEADLI | | ELSQLVTDFS | | LLVNSQQEKI |
DSIADHVNSA | | AVNVEEGTKN | | LGKAAKYKLA | | ALPVAGALIG | | GMVGGPIGLL |
AGFKVAGIAA | | ALGGGVLGFT | | GGKLIQRKKQ | | KMMEKLTSSC | | PDLPSQTDKK |
CS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, автофагія, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Muppirala M., Gupta V., Swarup G. (2011). Syntaxin 17 cycles between the ER and ERGIC and is required to maintain the architecture of ERGIC and Golgi. Biol. Cell. 103: 333—350. PMID 21545355 DOI:10.1042/BC20110006
- Muppirala M., Gupta V., Swarup G. (2012). Tyrosine phosphorylation of a SNARE protein, Syntaxin 17: Implications for membrane trafficking in the early secretory pathway. Biochim. Biophys. Acta. 1823: 2109—2119. PMID 23006999 DOI:10.1016/j.bbamcr.2012.09.003
- Itakura E., Kishi-Itakura C., Mizushima N. (2012). The hairpin-type tail-anchored SNARE syntaxin 17 targets to autophagosomes for fusion with endosomes/lysosomes. Cell. 151: 1256—1269. PMID 23217709 DOI:10.1016/j.cell.2012.11.001
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з STX17 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11432 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P56962 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |