SYT13 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SYT13

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WFM

Ідентифікатори

Символи

SYT13, synaptotagmin 13

Зовнішні ІД

OMIM: 607716 MGI: 1933945 HomoloGene: 10823 GeneCards: SYT13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium-dependent phospholipid binding • clathrin binding • calcium ion binding • syntaxin binding • SNARE binding • phosphatidylserine binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of plasma membrane • transport vesicle • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • presynapse • синапс • exocytic vesicle
Біологічний процес	• vesicle-mediated transport • vesicle fusion • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57586


80976

Ensembl


ENSG00000019505


ENSMUSG00000027220

UniProt


Q7L8C5


Q9EQT6

RefSeq (мРНК)


NM_020826 NM_001247987


NM_030725

RefSeq (білок)


NP_001234916 NP_065877


NP_109650

Локус (UCSC)

Хр. 11: 45.24 – 45.29 Mb

Хр. 2: 92.75 – 92.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYT13 (англ. Synaptotagmin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 46 885^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLSVPVIAL	GATLGTATSI	LALCGVTCLC	RHMHPKKGLL	PRDQDPDLEK
AKPSLLGSAQ	QFNVKKSTEP	VQPRALLKFP	DIYGPRPAVT	APEVINYADY
SLRSTEEPTA	PASPQPPNDS	RLKRQVTEEL	FILPQNGVVE	DVCVMETWNP
EKAASWNQAP	KLHYCLDYDC	QKAELFVTRL	EAVTSNHDGG	CDCYVQGSVA
NRTGSVEAQT	ALKKRQLHTT	WEEGLVLPLA	EEELPTATLT	LTLRTCDRFS
RHSVAGELRL	GLDGTSVPLG	AAQWGELKTS	AKEPSAGAGE	VLLSISYLPA
ANRLLVVLIK	AKNLHSNQSK	ELLGKDVSVK	VTLKHQARKL	KKKQTKRAKH
KINPVWNEMI	MFELPDDLLQ	ASSVELEVLG	QDDSGQSCAL	GHCSLGLHTS
GSERSHWEEM	LKNPRRQIAM	WHQLHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Craxton M.A. (2001). Genomic analysis of synaptotagmin genes. Genomics. 77: 43—49. PMID 11543631 DOI:10.1006/geno.2001.6619

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14962 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7L8C5 (англ.) . Архів оригіналу за 10 березня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.