TET3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TET3, hCG_40738, tet methylcytosine dioxygenase 3, BEFAHRS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 613555 MGI: 2446229 HomoloGene: 35360 GeneCards: TET3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • methylcytosine dioxygenase activity • iron ion binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинне ядро • хромосома • female pronucleus • male pronucleus |
---|
Біологічний процес | • histone H3-K4 trimethylation • protein O-linked glycosylation • multicellular organism development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • DNA demethylation of male pronucleus • DNA demethylation • 5-methylcytosine catabolic process • oxidative demethylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 73.98 – 74.11 Mb | Хр. 6: 83.34 – 83.44 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TET3 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 660 амінокислот, а молекулярна маса — 179 350[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSGPVYHGD | | SRQLSASGVP | | VNGAREPAGP | | SLLGTGGPWR | | VDQKPDWEAA |
PGPAHTARLE | | DAHDLVAFSA | | VAEAVSSYGA | | LSTRLYETFN | | REMSREAGNN |
SRGPRPGPEG | | CSAGSEDLDT | | LQTALALARH | | GMKPPNCNCD | | GPECPDYLEW |
LEGKIKSVVM | | EGGEERPRLP | | GPLPPGEAGL | | PAPSTRPLLS | | SEVPQISPQE |
GLPLSQSALS | | IAKEKNISLQ | | TAIAIEALTQ | | LSSALPQPSH | | STPQASCPLP |
EALSPPAPFR | | SPQSYLRAPS | | WPVVPPEEHS | | SFAPDSSAFP | | PATPRTEFPE |
AWGTDTPPAT | | PRSSWPMPRP | | SPDPMAELEQ | | LLGSASDYIQ | | SVFKRPEALP |
TKPKVKVEAP | | SSSPAPAPSP | | VLQREAPTPS | | SEPDTHQKAQ | | TALQQHLHHK |
RSLFLEQVHD | | TSFPAPSEPS | | APGWWPPPSS | | PVPRLPDRPP | | KEKKKKLPTP |
AGGPVGTEKA | | APGIKPSVRK | | PIQIKKSRPR | | EAQPLFPPVR | | QIVLEGLRSP |
ASQEVQAHPP | | APLPASQGSA | | VPLPPEPSLA | | LFAPSPSRDS | | LLPPTQEMRS |
PSPMTALQPG | | STGPLPPADD | | KLEELIRQFE | | AEFGDSFGLP | | GPPSVPIQDP |
ENQQTCLPAP | | ESPFATRSPK | | QIKIESSGAV | | TVLSTTCFHS | | EEGGQEATPT |
KAENPLTPTL | | SGFLESPLKY | | LDTPTKSLLD | | TPAKRAQAEF | | PTCDCVEQIV |
EKDEGPYYTH | | LGSGPTVASI | | RELMEERYGE | | KGKAIRIEKV | | IYTGKEGKSS |
RGCPIAKWVI | | RRHTLEEKLL | | CLVRHRAGHH | | CQNAVIVILI | | LAWEGIPRSL |
GDTLYQELTD | | TLRKYGNPTS | | RRCGLNDDRT | | CACQGKDPNT | | CGASFSFGCS |
WSMYFNGCKY | | ARSKTPRKFR | | LAGDNPKEEE | | VLRKSFQDLA | | TEVAPLYKRL |
APQAYQNQVT | | NEEIAIDCRL | | GLKEGRPFAG | | VTACMDFCAH | | AHKDQHNLYN |
GCTVVCTLTK | | EDNRCVGKIP | | EDEQLHVLPL | | YKMANTDEFG | | SEENQNAKVG |
SGAIQVLTAF | | PREVRRLPEP | | AKSCRQRQLE | | ARKAAAEKKK | | IQKEKLSTPE |
KIKQEALELA | | GITSDPGLSL | | KGGLSQQGLK | | PSLKVEPQNH | | FSSFKYSGNA |
VVESYSVLGN | | CRPSDPYSMN | | SVYSYHSYYA | | QPSLTSVNGF | | HSKYALPSFS |
YYGFPSSNPV | | FPSQFLGPGA | | WGHSGSSGSF | | EKKPDLHALH | | NSLSPAYGGA |
EFAELPSQAV | | PTDAHHPTPH | | HQQPAYPGPK | | EYLLPKAPLL | | HSVSRDPSPF |
AQSSNCYNRS | | IKQEPVDPLT | | QAEPVPRDAG | | KMGKTPLSEV | | SQNGGPSHLW |
GQYSGGPSMS | | PKRTNGVGGS | | WGVFSSGESP | | AIVPDKLSSF | | GASCLAPSHF |
TDGQWGLFPG | | EGQQAASHSG | | GRLRGKPWSP | | CKFGNSTSAL | | AGPSLTEKPW |
ALGAGDFNSA | | LKGSPGFQDK | | LWNPMKGEEG | | RIPAAGASQL | | DRAWQSFGLP |
LGSSEKLFGA | | LKSEEKLWDP | | FSLEEGPAEE | | PPSKGAVKEE | | KGGGGAEEEE |
EELWSDSEHN | | FLDENIGGVA | | VAPAHGSILI | | ECARRELHAT | | TPLKKPNRCH |
PTRISLVFYQ | | HKNLNQPNHG | | LALWEAKMKQ | | LAERARARQE | | EAARLGLGQQ |
EAKLYGKKRK | | WGGTVVAEPQ | | QKEKKGVVPT | | RQALAVPTDS | | AVTVSSYAYT |
KVTGPYSRWI |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription. Nature. 493: 561—564. PMID 23222540 DOI:10.1038/nature11742
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28313 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43151 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |