TOP3A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4CGY, 4CHT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TOP3A, TOP3, ZGRF7, topoisomerase (DNA) III alpha, DNA topoisomerase III alpha, PEOB5, MGRISCE2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601243 MGI: 1197527 HomoloGene: 3394 GeneCards: TOP3A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • isomerase activity • зв'язування з іоном металу • DNA topoisomerase activity • single-stranded DNA binding • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • PML body • нуклеоплазма • хромосома • клітинне ядро • мітохондрія • мітохондріальний матрикс |
---|
Біологічний процес | • реплікація ДНК • DNA topological change • GO:0007126 мейоз • mitochondrial DNA metabolic process • chromosome separation • regulation of signal transduction by p53 class mediator |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000284238 ENSG00000177302 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 18.27 – 18.32 Mb | Хр. 11: 60.63 – 60.67 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TOP3A (англ. DNA topoisomerase III alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 001 амінокислот, а молекулярна маса — 112 372[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MIFPVARYAL | | RWLRRPEDRA | | FSRAAMEMAL | | RGVRKVLCVA | | EKNDAAKGIA |
DLLSNGRMRR | | REGLSKFNKI | | YEFDYHLYGQ | | NVTMVMTSVS | | GHLLAHDFQM |
QFRKWQSCNP | | LVLFEAEIEK | | YCPENFVDIK | | KTLERETRQC | | QALVIWTDCD |
REGENIGFEI | | IHVCKAVKPN | | LQVLRARFSE | | ITPHAVRTAC | | ENLTEPDQRV |
SDAVDVRQEL | | DLRIGAAFTR | | FQTLRLQRIF | | PEVLAEQLIS | | YGSCQFPTLG |
FVVERFKAIQ | | AFVPEIFHRI | | KVTHDHKDGI | | VEFNWKRHRL | | FNHTACLVLY |
QLCVEDPMAT | | VVEVRSKPKS | | KWRPQALDTV | | ELEKLASRKL | | RINAKETMRI |
AEKLYTQGYI | | SYPRTETNIF | | PRDLNLTVLV | | EQQTPDPRWG | | AFAQSILERG |
GPTPRNGNKS | | DQAHPPIHPT | | KYTNNLQGDE | | QRLYEFIVRH | | FLACCSQDAQ |
GQETTVEIDI | | AQERFVAHGL | | MILARNYLDV | | YPYDHWSDKI | | LPVYEQGSHF |
QPSTVEMVDG | | ETSPPKLLTE | | ADLIALMEKH | | GIGTDATHAE | | HIETIKARMY |
VGLTPDKRFL | | PGHLGMGLVE | | GYDSMGYEMS | | KPDLRAELEA | | DLKLICDGKK |
DKFVVLRQQV | | QKYKQVFIEA | | VAKAKKLDEA | | LAQYFGNGTE | | LAQQEDIYPA |
MPEPIRKCPQ | | CNKDMVLKTK | | KNGGFYLSCM | | GFPECRSAVW | | LPDSVLEASR |
DSSVCPVCQP | | HPVYRLKLKF | | KRGSLPPTMP | | LEFVCCIGGC | | DDTLREILDL |
RFSGGPPRAS | | QPSGRLQANQ | | SLNRMDNSQH | | PQPADSRQTG | | SSKALAQTLP |
PPTAAGESNS | | VTCNCGQEAV | | LLTVRKEGPN | | RGRQFFKCNG | | GSCNFFLWAD |
SPNPGAGGPP | | ALAYRPLGAS | | LGCPPGPGIH | | LGGFGNPGDG | | SGSGTSCLCS |
QPSVTRTVQK | | DGPNKGRQFH | | TCAKPREQQC | | GFFQWVDENT | | APGTSGAPSW |
TGDRGRTLES | | EARSKRPRAS | | SSDMGSTAKK | | PRKCSLCHQP | | GHTRPFCPQN |
R |
Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію.
Література
- Hanai R., Caron P.R., Wang J.C. (1996). Human TOP3: a single-copy gene encoding DNA topoisomerase III. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 3653—3657. PMID 8622991 DOI:10.1073/pnas.93.8.3653
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yang J., Bachrati C.Z., Ou J., Hickson I.D., Brown G.W. (2010). Human topoisomerase IIIalpha is a single-stranded DNA decatenase that is stimulated by BLM and RMI1. J. Biol. Chem. 285: 21426—21436. PMID 20445207 DOI:10.1074/jbc.M110.123216
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11992 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13472 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |