TRAIP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4ZTD

Ідентифікатори

Символи

TRAIP, RNF206, TRIP, SCKL9, TRAF interacting protein

Зовнішні ІД

OMIM: 605958 MGI: 1096377 HomoloGene: 31343 GeneCards: TRAIP

Пов'язані генетичні захворювання

Seckel syndrome 9^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес	• проліферація • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of interferon-beta production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10293


22036

Ensembl


ENSG00000183763


ENSMUSG00000032586

UniProt


Q9BWF2


Q8VIG6

RefSeq (мРНК)


NM_005879


NM_011634

RefSeq (білок)


NP_005870


NP_035764

Локус (UCSC)

Хр. 3: 49.83 – 49.86 Mb

Хр. 9: 107.83 – 107.85 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAIP (англ. TRAF interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 53 294^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPIRALCTIC	SDFFDHSRDV	AAIHCGHTFH	LQCLIQWFET	APSRTCPQCR
IQVGKRTIIN	KLFFDLAQEE	ENVLDAEFLK	NELDNVRAQL	SQKDKEKRDS
QVIIDTLRDT	LEERNATVVS	LQQALGKAEM	LCSTLKKQMK	YLEQQQDETK
QAQEEARRLR	SKMKTMEQIE	LLLQSQRPEV	EEMIRDMGVG	QSAVEQLAVY
CVSLKKEYEN	LKEARKASGE	VADKLRKDLF	SSRSKLQTVY	SELDQAKLEL
KSAQKDLQSA	DKEIMSLKKK	LTMLQETLNL	PPVASETVDR	LVLESPAPVE
VNLKLRRPSF	RDDIDLNATF	DVDTPPARPS	SSQHGYYEKL	CLEKSHSPIQ
DVPKKICKGP	RKESQLSLGG	QSCAGEPDEE	LVGAFPIFVR	NAILGQKQPK
RPRSESSCSK	DVVRTGFDGL	GGRTKFIQPT	DTVMIRPLPV	KPKTKVKQRV
RVKTVPSLFQ	AKLDTFLWS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Lee S.Y., Lee S.Y., Choi Y. (1997). TRAF-interacting protein (TRIP): a novel component of the tumor necrosis factor receptor (TNFR)- and CD30-TRAF signaling complexes that inhibits TRAF2-mediated NF-kappaB activation. J. Exp. Med. 185: 1275—1285. PMID 9104814 DOI:10.1084/jem.185.7.1275
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRAIP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30764 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BWF2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.