TRAK1

Ідентифікатори

Символи

TRAK1, MILT1, OIP106, trafficking kinesin protein 1, EIEE68, DEE68

Зовнішні ІД

OMIM: 608112 MGI: 1914345 HomoloGene: 25103 GeneCards: TRAK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GABA receptor binding • TPR domain binding • signaling receptor binding • myosin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • early endosome • мітохондрія • клітинне ядро • axon cytoplasm • дендрит (нейробіологія) • axonal growth cone • perinuclear region of cytoplasm • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • dendrite cytoplasm • cell cortex • мембрана • мітохондріальна мембрана
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • сортування білків • protein O-linked glycosylation • endosome to lysosome transport • anterograde axonal transport of mitochondrion • axonal transport of mitochondrion • dendrite morphogenesis • positive regulation of axonogenesis • anterograde axonal transport • GO:0034613 protein localization • Нейрогенез • vesicle transport along microtubule • mitochondrion distribution
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22906


67095

Ensembl


ENSG00000182606


ENSMUSG00000032536

UniProt


Q9UPV9


Q6PD31

RefSeq (мРНК)

NM_001042646 NM_001265608 NM_001265609 NM_001265610 NM_014965
NM_001349245 NM_001349246 NM_001349247 NM_001349248 NM_001349249

NM_175114 NM_001357968 NM_001357969 NM_001357970 NM_001357972
NM_001357973

RefSeq (білок)

NP_001036111 NP_001252537 NP_001252538 NP_001252539 NP_055780
NP_001336174 NP_001336175 NP_001336176 NP_001336177 NP_001336178

NP_780323 NP_001344897 NP_001344898 NP_001344899 NP_001344901
NP_001344902

Локус (UCSC)

Хр. 3: 42.01 – 42.23 Mb

Хр. 9: 121.13 – 121.3 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAK1 (англ. Trafficking kinesin protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 953 амінокислот, а молекулярна маса — 106 040^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALVFQFGQP	VRAQPLPGLC	HGKLIRTNAC	DVCNSTDLPE	VEIISLLEEQ
LPHYKLRADT	IYGYDHDDWL	HTPLISPDAN	IDLTTEQIEE	TLKYFLLCAE
RVGQMTKTYN	DIDAVTRLLE	EKERDLELAA	RIGQSLLKKN	KTLTERNELL
EEQVEHIREE	VSQLRHELSM	KDELLQFYTS	AAEESEPESV	CSTPLKRNES
SSSVQNYFHL	DSLQKKLKDL	EEENVVLRSE	ASQLKTETIT	YEEKEQQLVN
DCVKELRDAN	VQIASISEEL	AKKTEDAARQ	QEEITHLLSQ	IVDLQKKAKA
CAVENEELVQ	HLGAAKDAQR	QLTAELRELE	DKYAECMEML	HEAQEELKNL
RNKTMPNTTS	RRYHSLGLFP	MDSLAAEIEG	TMRKELQLEE	AESPDITHQK
RVFETVRNIN	QVVKQRSLTP	SPMNIPGSNQ	SSAMNSLLSS	CVSTPRSSFY
GSDIGNVVLD	NKTNSIILET	EAADLGNDER	SKKPGTPGTP	GSHDLETALR
RLSLRRENYL	SERRFFEEEQ	ERKLQELAEK	GELRSGSLTP	TESIMSLGTH
SRFSEFTGFS	GMSFSSRSYL	PEKLQIVKPL	EGSATLHHWQ	QLAQPHLGGI
LDPRPGVVTK	GFRTLDVDLD	EVYCLNDFEE	DDTGDHISLP	RLATSTPVQH
PETSAHHPGK	CMSQTNSTFT	FTTCRILHPS	DELTRVTPSL	NSAPTPACGS
TSHLKSTPVA	TPCTPRRLSL	AESFTNTRES	TTTMSTSLGL	VWLLKERGIS
AAVYDPQSWD	RAGRGSLLHS	YTPKMAVIPS	TPPNSPMQTP	TSSPPSFEFK
CTSPPYDNFL	ASKPASSILR	EVREKNVRSS	ESQTDVSVSN	LNLVDKVRRF
GVAKVVNSGR	AHVPTLTEEQ	GPLLCGPPGP	APALVPRGLV	PEGLPLRCPT
VTSAIGGLQL	NSGIRRNRSF	PTMVGSSMQM	KAPVTLTSGI	LMGAKLSKQT
SLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Iyer S.P.N., Akimoto Y., Hart G.W. (2003). Identification and cloning of a novel family of coiled-coil domain proteins that interact with O-GlcNAc transferase. J. Biol. Chem. 278: 5399—5409. PMID 12435728 DOI:10.1074/jbc.M209384200
Brickley K., Smith M.J., Beck M., Stephenson F.A. (2005). GRIF-1 and OIP106, members of a novel gene family of coiled-coil domain proteins: association in vivo and in vitro with kinesin. J. Biol. Chem. 280: 14723—14732. PMID 15644324 DOI:10.1074/jbc.M409095200
Fransson S., Ruusala A., Aspenstroem P. (2006). The atypical Rho GTPases Miro-1 and Miro-2 have essential roles in mitochondrial trafficking. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 500—510. PMID 16630562 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.03.163
Webber E., Li L., Chin L.S. (2008). Hypertonia-associated protein Trak1 is a novel regulator of endosome-to-lysosome trafficking. J. Mol. Biol. 382: 638—651. PMID 18675823 DOI:10.1016/j.jmb.2008.07.045

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29947 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UPV9 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.