TROVE2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RO60, RORNP, SSA2, TROVE domain family member 2, Ro60, Y RNA binding protein, TROVE2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600063 MGI: 106652 HomoloGene: 3383 GeneCards: RO60 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • U2 snRNA binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • immune system development • transcription by RNA polymerase III • smoothened signaling pathway • response to UV • cilium assembly • cell projection organization • регуляція експресії генів • cellular response to interferon-alpha |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001042369 NM_001042370 NM_001173524 NM_001173525 NM_004600
| NM_001331020 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001035828 NP_001035829 NP_001166995 NP_001166996 NP_001317949
| NP_004591 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 193.06 – 193.09 Mb | Хр. 1: 143.63 – 143.65 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TROVE2 (англ. TROVE domain family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 538 амінокислот, а молекулярна маса — 60 671[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEESVNQMQP | | LNEKQIANSQ | | DGYVWQVTDM | | NRLHRFLCFG | | SEGGTYYIKE |
QKLGLENAEA | | LIRLIEDGRG | | CEVIQEIKSF | | SQEGRTTKQE | | PMLFALAICS |
QCSDISTKQA | | AFKAVSEVCR | | IPTHLFTFIQ | | FKKDLKESMK | | CGMWGRALRK |
AIADWYNEKG | | GMALALAVTK | | YKQRNGWSHK | | DLLRLSHLKP | | SSEGLAIVTK |
YITKGWKEVH | | ELYKEKALSV | | ETEKLLKYLE | | AVEKVKRTRD | | ELEVIHLIEE |
HRLVREHLLT | | NHLKSKEVWK | | ALLQEMPLTA | | LLRNLGKMTA | | NSVLEPGNSE |
VSLVCEKLCN | | EKLLKKARIH | | PFHILIALET | | YKTGHGLRGK | | LKWRPDEEIL |
KALDAAFYKT | | FKTVEPTGKR | | FLLAVDVSAS | | MNQRVLGSIL | | NASTVAAAMC |
MVVTRTEKDS | | YVVAFSDEMV | | PCPVTTDMTL | | QQVLMAMSQI | | PAGGTDCSLP |
MIWAQKTNTP | | ADVFIVFTDN | | ETFAGGVHPA | | IALREYRKKM | | DIPAKLIVCG |
MTSNGFTIAD | | PDDRGMLDMC | | GFDTGALDVI | | RNFTLDMI |
Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біогенез та деградація війок, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Deutscher S.L., Harley J.B., Keene J.D. (1988). Molecular analysis of the 60-kDa human Ro ribonucleoprotein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 9479—9483. PMID 3200833 DOI:10.1073/pnas.85.24.9479
- Ben-Chetrit E., Gandy B.J., Tan E.M., Sulivan K.F. (1989). Isolation and characterization of a cDNA clone encoding the 60-kD component of the human SS-A/Ro ribonucleoprotein autoantigen. J. Clin. Invest. 83: 1284—1292. PMID 2649513 DOI:10.1172/JCI114013
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wang D., Buyon J.P., Zhu W., Chan E.K.L. (1999). Defining a novel 75-kDa phosphoprotein associated with SS-A/Ro and identification of distinct human autoantibodies. J. Clin. Invest. 104: 1265—1275. PMID 10545525 DOI:10.1172/JCI8003
- Bouffard P., Barbar E., Briere F., Boire G. (2000). Interaction cloning and characterization of RoBPI, a novel protein binding to human Ro ribonucleoproteins. RNA. 6: 66—78. PMID 10668799 DOI:10.1017/S1355838200990277
- Hogg J.R., Collins K. (2007). Human Y5 RNA specializes a Ro ribonucleoprotein for 5S ribosomal RNA quality control. Genes Dev. 21: 3067—3072. PMID 18056422 DOI:10.1101/gad.1603907
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11313 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P10155 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |