UBE2B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1JAS, 2Y4W, 2YB6, 2YBF | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | UBE2B, E2-17kDa, HHR6B, HR6B, RAD6B, UBC2, ubiquitin conjugating enzyme E2 B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 179095 MGI: 102944 HomoloGene: 101298 GeneCards: UBE2B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin conjugating enzyme activity • ubiquitin protein ligase binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • replication fork • HULC complex • нуклеоплазма • XY body • Хроматин • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • chiasma assembly • histone H2A ubiquitination • negative regulation of cAMP-mediated signaling • postreplication repair • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein K63-linked ubiquitination • meiotic telomere clustering • positive regulation of reciprocal meiotic recombination • protein stabilization • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • in utero embryonic development • protein monoubiquitination • sperm axoneme assembly • cellular response to DNA damage stimulus • protein K11-linked ubiquitination • histone lysine demethylation • protein K48-linked ubiquitination • GO:0033127, GO:2000281, GO:2000817 regulation of histone modification • Сперматогенез • canonical Wnt signaling pathway • synaptonemal complex organization • response to UV • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_009458 NM_001362685 NM_001362686 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_033484 NP_001349614 NP_001349615 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 134.37 – 134.39 Mb | Хр. 11: 51.88 – 51.89 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
UBE2B (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 312[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTPARRRLM | | RDFKRLQEDP | | PVGVSGAPSE | | NNIMQWNAVI | | FGPEGTPFED |
GTFKLVIEFS | | EEYPNKPPTV | | RFLSKMFHPN | | VYADGSICLD | | ILQNRWSPTY |
DVSSILTSIQ | | SLLDEPNPNS | | PANSQAAQLY | | QENKREYEKR | | VSAIVEQSWN |
DS |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.
Література
- Woffendin C., Chen Z.Y., Staskus K., Retzel E.F., Plagemann P.G. (1991). Mammalian mRNAs encoding protein closely related to ubiquitin-conjugating enzyme encoded by yeast DNA repair gene RAD6. Biochim. Biophys. Acta. 1090: 81—85. PMID 1883845 DOI:10.1016/0167-4781(91)90039-O
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kim J., Hake S.B., Roeder R.G. (2005). The human homolog of yeast BRE1 functions as a transcriptional coactivator through direct activator interactions. Mol. Cell. 20: 759—770. PMID 16337599 DOI:10.1016/j.molcel.2005.11.012
- David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 DOI:10.1074/jbc.M109.089003
- Zhang F., Yu X. (2011). WAC, a functional partner of RNF20/40, regulates histone H2B ubiquitination and gene transcription. Mol. Cell. 41: 384—397. PMID 21329877 DOI:10.1016/j.molcel.2011.01.024
- Miura T., Klaus W., Ross A., Guntert P., Senn H. (2002). The NMR structure of the class I human ubiquitin-conjugating enzyme 2b. J. Biomol. NMR. 22: 89—92. PMID 11885984 DOI:10.1023/A:1013807519703
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12473 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P63146 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |