UBE4A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | UBE4A, E4, UBOX2, UFD2, ubiquitination factor E4A, NEDHMS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603753 MGI: 2154580 HomoloGene: 3517 GeneCards: UBE4A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • ubiquitin-ubiquitin ligase activity |
---|
Клітинна компонента | • ubiquitin ligase complex • клітинне ядро • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent ERAD pathway • protein polyubiquitination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_145400 NM_001346698 NM_001361075 NM_001361076 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001333627 NP_663375 NP_001348004 NP_001348005 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 118.36 – 118.4 Mb | Хр. 9: 44.83 – 44.88 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
UBE4A (англ. Ubiquitination factor E4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 066 амінокислот, а молекулярна маса — 122 561[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTDQENNNNI | | SSNPFAALFG | | SLADAKQFAA | | IQKEQLKQQS | | DELPASPDDS |
DNSVSESLDE | | FDYSVAEISR | | SFRSQQEICE | | QLNINHMIQR | | IFLITLDNSD |
PSLKSGNGIP | | SRCVYLEEMA | | VELEDQDWLD | | MSNVEQALFA | | RLLLQDPGNH |
LINMTSSTTL | | NLSADRDAGE | | RHIFCYLYSC | | FQRAKEEITK | | VPENLLPFAV |
QCRNLTVSNT | | RTVLLTPEIY | | VDQNIHEQLV | | DLMLEAIQGA | | HFEDVTEFLE |
EVIEALILDE | | EVRTFPEVMI | | PVFDILLGRI | | KDLELCQILL | | YAYLDILLYF |
TRQKDMAKVF | | VEYIQPKDPT | | NGQMYQKTLL | | GVILSISCLL | | KTPGVVENHG |
YFLNPSRSSP | | QEIKVQEANI | | HQFMAQFHEK | | IYQMLKNLLQ | | LSPETKHCIL |
SWLGNCLHAN | | AGRTKIWANQ | | MPEIFFQMYA | | SDAFFLNLGA | | ALLKLCQPFC |
KPRSSRLLTF | | NPTYCALKEL | | NDEERKIKNV | | HMRGLDKETC | | LIPAVQEPKF |
PQNYNLVTEN | | LALTEYTLYL | | GFHRLHDQMV | | KINQNLHRLQ | | VAWRDAQQSS |
SPAADNLREQ | | FERLMTIYLS | | TKTAMTEPQM | | LQNCLNLQVS | | MAVLLVQLAI |
GNEGSQPIEL | | TFPLPDGYSS | | LAYVPEFFAD | | NLGDFLIFLR | | RFADDILETS |
ADSLEHVLHF | | ITIFTGSIER | | MKNPHLRAKL | | AEVLEAVMPH | | LDQTPNPLVS |
SVFHRKRVFC | | NFQYAPQLAE | | ALIKVFVDIE | | FTGDPHQFEQ | | KFNYRRPMYP |
ILRYMWGTDT | | YRESIKDLAD | | YASKNLEAMN | | PPLFLRFLNL | | LMNDAIFLLD |
EAIQYLSKIK | | IQQIEKDRGE | | WDSLTPEARR | | EKEAGLQMFG | | QLARFHNIMS |
NETIGTLAFL | | TSEIKSLFVH | | PFLAERIISM | | LNYFLQHLVG | | PKMGALKVKD |
FSEFDFKPQQ | | LVSDICTIYL | | NLGDEENFCA | | TVPKDGRSYS | | PTLFAQTVRV |
LKKINKPGNM | | IMAFSNLAER | | IKSLADLQQQ | | EEETYADACD | | EFLDPIMSTL |
MCDPVVLPSS | | RVTVDRSTIA | | RHLLSDQTDP | | FNRSPLTMDQ | | IRPNTELKEK |
IQRWLAERKQ | | QKEQLE |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12499 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14139 (англ.) . Архів оригіналу за 29 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |