UBE4B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KRE, 3L1X, 3L1Z

Ідентифікатори

Символи

UBE4B, E4, HDNB1, UBOX3, UFD2, UFD2A, ubiquitination factor E4B

Зовнішні ІД

OMIM: 613565 MGI: 1927086 HomoloGene: 107623 GeneCards: UBE4B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • ATPase binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • enzyme binding • ATP binding • transferase activity • ubiquitin-ubiquitin ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• ubiquitin ligase complex • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• protein monoubiquitination • response to endoplasmic reticulum stress • ventricular trabecula myocardium morphogenesis • Убіквітин-залежний протеоліз • neuron projection development • granzyme-mediated apoptotic signaling pathway • response to UV • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination • protein polyubiquitination • ubiquitin-dependent ERAD pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10277


63958

Ensembl


ENSG00000130939


ENSMUSG00000028960

UniProt


O95155


Q9ES00

RefSeq (мРНК)


NM_001105562 NM_006048


NM_022022

RefSeq (білок)


NP_001099032 NP_006039


NP_071305 NP_001391797 NP_001391798

Локус (UCSC)

Хр. 1: 10.03 – 10.18 Mb

Хр. 4: 149.33 – 149.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBE4B (англ. Ubiquitination factor E4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 302 амінокислот, а молекулярна маса — 146 185^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELSADEIR	RRRLARLAGG	QTSQPTTPLT	SPQRENPPGP	PIAASAPGPS
QSLGLNVHNM	TPATSPIGAS	GVAHRSQSSE	GVSSLSSSPS	NSLETQSQSL
SRSQSMDIDG	VSCEKSMSQV	DVDSGIENME	VDENDRREKR	SLSDKEPSSG
PEVSEEQALQ	LVCKIFRVSW	KDRDRDVIFL	SSLSAQFKQN	PKEVFSDFKD
LIGQILMEVL	MMSTQTRDEN	PFASLTATSQ	PIAAAARSPD	RNLLLNTGSN
PGTSPMFCSV	ASFGASSLSS	LYESSPAPTP	SFWSSVPVMG	PSLASPSRAA
SQLAVPSTPL	SPHSAASGTA	AGSQPSSPRY	RPYTVTHPWA	SSGVSILSSS
PSPPALASSP	QAVPASSSRQ	RPSSTGPPLP	PASPSATSRR	PSSLRISPSL
GASGGASNWD	SYSDHFTIET	CKETDMLNYL	IECFDRVGIE	EKKAPKMCSQ
PAVSQLLSNI	RSQCISHTAL	VLQGSLTQPR	SLQQPSFLVP	YMLCRNLPYG
FIQELVRTTH	QDEEVFKQIF	IPILQGLALA	AKECSLDSDY	FKYPLMALGE
LCETKFGKTH	PVCNLVASLR	LWLPKSLSPG	CGRELQRLSY	LGAFFSFSVF
AEDDVKVVEK	YFSGPAITLE	NTRVVSQSLQ	HYLELGRQEL	FKILHSILLN
GETREAALSY	MAAVVNANMK	KAQMQTDDRL	VSTDGFMLNF	LWVLQQLSTK
IKLETVDPTY	IFHPRCRITL	PNDETRVNAT	MEDVNDWLTE	LYGDQPPFSE
PKFPTECFFL	TLHAHHLSIL	PSCRRYIRRL	RAIRELNRTV	EDLKNNESQW
KDSPLATRHR	EMLKRCKTQL	KKLVRCKACA	DAGLLDESFL	RRCLNFYGLL
IQLLLRILDP	AYPDITLPLN	SDVPKVFAAL	PEFYVEDVAE	FLFFIVQYSP
QALYEPCTQD	IVMFLVVMLC	NQNYIRNPYL	VAKLVEVMFM	TNPAVQPRTQ
KFFEMIENHP	LSTKLLVPSL	MKFYTDVEHT	GATSEFYDKF	TIRYHISTIF
KSLWQNIAHH	GTFMEEFNSG	KQFVRYINML	INDTTFLLDE	SLESLKRIHE
VQEEMKNKEQ	WDQLPRDQQQ	ARQSQLAQDE	RVSRSYLALA	TETVDMFHIL
TKQVQKPFLR	PELGPRLAAM	LNFNLQQLCG	PKCRDLKVEN	PEKYGFEPKK
LLDQLTDIYL	QLDCARFAKA	IADDQRSYSK	ELFEEVISKM	RKAGIKSTIA
IEKFKLLAEK	VEEIVAKNAR	AEIDYSDAPD	EFRDPLMDTL	MTDPVRLPSG
TIMDRSIILR	HLLNSPTDPF	NRQTLTESML	EPVPELKEQI	QAWMREKQNS
DH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Onyango P., Lubyova B., Gardellin P., Kurzbauer R., Weith A. (1998). Molecular cloning and expression analysis of five novel genes in chromosome 1p36. Genomics. 50: 187—198. PMID 9653645 DOI:10.1006/geno.1997.5186
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12500 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O95155 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.