USP19 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1WH0, 4X3G | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | USP19, ZMYND9, ubiquitin specific peptidase 19 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614471 MGI: 1918722 HomoloGene: 41730 GeneCards: USP19 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • Hsp90 protein binding • cysteine-type peptidase activity • зв'язування з іоном металу • Lys48-specific deubiquitinase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • protein K48-linked deubiquitination • regulation of protein stability • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein stabilization • response to endoplasmic reticulum stress • протеоліз • regulation of ERAD pathway • regulation of cellular response to hypoxia • negative regulation of skeletal muscle tissue development • positive regulation of cell cycle process • ubiquitin-dependent ERAD pathway • negative regulation of proteasomal protein catabolic process • protein deubiquitination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001199160 NM_001199161 NM_001199162 NM_006677 NM_001351098
| NM_001351099 NM_001351100 NM_001351101 NM_001351102 NM_001351103 NM_001351104 NM_001351105 NM_001351106 NM_001351107 NM_001351108 NM_001389594 NM_001389595 NM_001389596 NM_001389597 NM_001389598 NM_001389599 NM_001389600 NM_001389601 NM_001389602 NM_001389603 NM_001389604 NM_001389605 NM_001389606 NM_001389607 NM_001389608 NM_001400288 NM_001400290 NM_001400292 NM_001400293 NM_001400294 NM_001400295 NM_001400296 NM_001400297 NM_001400298 NM_001400299 |
| | NM_001168371 NM_001168372 NM_001168373 NM_027804 NM_145407 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001186089 NP_001186090 NP_001186091 NP_006668 NP_001338027
| NP_001338028 NP_001338029 NP_001338030 NP_001338031 NP_001338032 NP_001338033 NP_001338034 NP_001338035 NP_001338036 NP_001338037 |
| | NP_001161843 NP_001161844 NP_001161845 NP_082080 NP_663382 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 49.11 – 49.12 Mb | Хр. 9: 108.37 – 108.38 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
USP19 (англ. Ubiquitin specific peptidase 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 318 амінокислот, а молекулярна маса — 145 651[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGGASATGP | | RRGPPGLEDT | | TSKKKQKDRA | | NQESKDGDPR | | KETGSRYVAQ |
AGLEPLASGD | | PSASASHAAG | | ITGSRHRTRL | | FFPSSSGSAS | | TPQEEQTKEG |
ACEDPHDLLA | | TPTPELLLDW | | RQSAEEVIVK | | LRVGVGPLQL | | EDVDAAFTDT |
DCVVRFAGGQ | | QWGGVFYAEI | | KSSCAKVQTR | | KGSLLHLTLP | | KKVPMLTWPS |
LLVEADEQLC | | IPPLNSQTCL | | LGSEENLAPL | | AGEKAVPPGN | | DPVSPAMVRS |
RNPGKDDCAK | | EEMAVAADAA | | TLVDEPESMV | | NLAFVKNDSY | | EKGPDSVVVH |
VYVKEICRDT | | SRVLFREQDF | | TLIFQTRDGN | | FLRLHPGCGP | | HTTFRWQVKL |
RNLIEPEQCT | | FCFTASRIDI | | CLRKRQSQRW | | GGLEAPAARV | | GGAKVAVPTG |
PTPLDSTPPG | | GAPHPLTGQE | | EARAVEKDKS | | KARSEDTGLD | | SVATRTPMEH |
VTPKPETHLA | | SPKPTCMVPP | | MPHSPVSGDS | | VEEEEEEEKK | | VCLPGFTGLV |
NLGNTCFMNS | | VIQSLSNTRE | | LRDFFHDRSF | | EAEINYNNPL | | GTGGRLAIGF |
AVLLRALWKG | | THHAFQPSKL | | KAIVASKASQ | | FTGYAQHDAQ | | EFMAFLLDGL |
HEDLNRIQNK | | PYTETVDSDG | | RPDEVVAEEA | | WQRHKMRNDS | | FIVDLFQGQY |
KSKLVCPVCA | | KVSITFDPFL | | YLPVPLPQKQ | | KVLPVFYFAR | | EPHSKPIKFL |
VSVSKENSTA | | SEVLDSLSQS | | VHVKPENLRL | | AEVIKNRFHR | | VFLPSHSLDT |
VSPSDTLLCF | | ELLSSELAKE | | RVVVLEVQQR | | PQVPSVPISK | | CAACQRKQQS |
EDEKLKRCTR | | CYRVGYCNQL | | CQKTHWPDHK | | GLCRPENIGY | | PFLVSVPASR |
LTYARLAQLL | | EGYARYSVSV | | FQPPFQPGRM | | ALESQSPGCT | | TLLSTGSLEA |
GDSERDPIQP | | PELQLVTPMA | | EGDTGLPRVW | | AAPDRGPVPS | | TSGISSEMLA |
SGPIEVGSLP | | AGERVSRPEA | | AVPGYQHPSE | | AMNAHTPQFF | | IYKIDSSNRE |
QRLEDKGDTP | | LELGDDCSLA | | LVWRNNERLQ | | EFVLVASKEL | | ECAEDPGSAG |
EAARAGHFTL | | DQCLNLFTRP | | EVLAPEEAWY | | CPQCKQHREA | | SKQLLLWRLP |
NVLIVQLKRF | | SFRSFIWRDK | | INDLVEFPVR | | NLDLSKFCIG | | QKEEQLPSYD |
LYAVINHYGG | | MIGGHYTACA | | RLPNDRSSQR | | SDVGWRLFDD | | STVTTVDESQ |
VVTRYAYVLF | | YRRRNSPVER | | PPRAGHSEHH | | PDLGPAAEAA | | ASQASRIWQE |
LEAEEEPVPE | | GSGPLGPWGP | | QDWVGPLPRG | | PTTPDEGCLR | | YFVLGTVAAL |
VALVLNVFYP | | LVSQSRWR |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mei Y., Hahn A.A., Hu S., Yang X. (2011). The USP19 deubiquitinase regulates the stability of c-IAP1 and c-IAP2. J. Biol. Chem. 286: 35380—35387. PMID 21849505 DOI:10.1074/jbc.M111.282020
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12617 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O94966 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |