USP48

Ідентифікатори

Символи

USP48, RAP1GA1, USP31, ubiquitin specific peptidase 48

Зовнішні ІД

OMIM: 617445 MGI: 2158502 HomoloGene: 12988 GeneCards: USP48

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • мітохондрія • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84196


170707

Ensembl


ENSG00000090686


ENSMUSG00000043411

UniProt


Q86UV5


Q3V0C5

RefSeq (мРНК)

NM_001032730 NM_032236 NM_001330394 NM_001350164 NM_001350166
NM_001350167 NM_001350168


NM_130879 NM_001347227 NM_001355588

RefSeq (білок)

NP_001027902 NP_001317323 NP_115612 NP_001337093 NP_001337095
NP_001337096 NP_001337097

NP_001334156 NP_570949 NP_001342517 NP_001392866 NP_001392867
NP_001392868 NP_001392869 NP_001392871 NP_001392872 NP_001392873 NP_001392880 NP_001392881 NP_001392882 NP_001392883 NP_001392884

Локус (UCSC)

Хр. 1: 21.68 – 21.78 Mb

Хр. 4: 137.59 – 137.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USP48 (англ. Ubiquitin specific peptidase 48) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 035 амінокислот, а молекулярна маса — 119 032^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPRLQLEKA	AWRWAETVRP	EEVSQEHIET	AYRIWLEPCI	RGVCRRNCKG
NPNCLVGIGE	HIWLGEIDEN	SFHNIDDPNC	ERRKKNSFVG	LTNLGATCYV
NTFLQVWFLN	LELRQALYLC	PSTCSDYMLG	DGIQEEKDYE	PQTICEHLQY
LFALLQNSNR	RYIDPSGFVK	ALGLDTGQQQ	DAQEFSKLFM	SLLEDTLSKQ
KNPDVRNIVQ	QQFCGEYAYV	TVCNQCGRES	KLLSKFYELE	LNIQGHKQLT
DCISEFLKEE	KLEGDNRYFC	ENCQSKQNAT	RKIRLLSLPC	TLNLQLMRFV
FDRQTGHKKK	LNTYIGFSEI	LDMEPYVEHK	GGSYVYELSA	VLIHRGVSAY
SGHYIAHVKD	PQSGEWYKFN	DEDIEKMEGK	KLQLGIEEDL	AEPSKSQTRK
PKCGKGTHCS	RNAYMLVYRL	QTQEKPNTTV	QVPAFLQELV	DRDNSKFEEW
CIEMAEMRKQ	SVDKGKAKHE	EVKELYQRLP	AGAEPYEFVS	LEWLQKWLDE
STPTKPIDNH	ACLCSHDKLH	PDKISIMKRI	SEYAADIFYS	RYGGGPRLTV
KALCKECVVE	RCRILRLKNQ	LNEDYKTVNN	LLKAAVKGSD	GFWVGKSSLR
SWRQLALEQL	DEQDGDAEQS	NGKMNGSTLN	KDESKEERKE	EEELNFNEDI
LCPHGELCIS	ENERRLVSKE	AWSKLQQYFP	KAPEFPSYKE	CCSQCKILER
EGEENEALHK	MIANEQKTSL	PNLFQDKNRP	CLSNWPEDTD	VLYIVSQFFV
EEWRKFVRKP	TRCSPVSSVG	NSALLCPHGG	LMFTFASMTK	EDSKLIALIW
PSEWQMIQKL	FVVDHVIKIT	RIEVGDVNPS	ETQYISEPKL	CPECREGLLC
QQQRDLREYT	QATIYVHKVV	DNKKVMKDSA	PELNVSSSET	EEDKEEAKPD
GEKDPDFNQS	NGGTKRQKIS	HQNYIAYQKQ	VIRRSMRHRK	VRGEKALLVS
ANQTLKELKI	QIMHAFSVAP	FDQNLSIDGK	ILSDDCATLG	TLGVIPESVI
LLKADEPIAD	YAAMDDVMQV	CMPEEGFKGT	GLLGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18533 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q86UV5 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.