USP6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | USP6, HRP1, TRE17, TRE2, TRESMCR, Tre-2, USP6-short, ubiquitin specific peptidase 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604334 HomoloGene: 136783 GeneCards: USP6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • nucleic acid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • calmodulin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • recycling endosome • ендосома • клітинна мембрана • лізосома • мембрана |
---|
Біологічний процес | • protein deubiquitination • regulation of vesicle-mediated transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • intracellular protein transport • regulation of vesicle fusion • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001304284 NM_004505 NM_005152 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 5.12 – 5.18 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | н/д |
---|
Вікідані |
|
USP6 (англ. Ubiquitin specific peptidase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 406 амінокислот, а молекулярна маса — 158 658[3].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDMVENADSL | | QAQERKDILM | | KYDKGHRAGL | | PEDKGPEPVG | | INSSIDRFGI |
LHETELPPVT | | AREAKKIRRE | | MTRTSKWMEM | | LGEWETYKHS | | SKLIDRVYKG |
IPMNIRGPVW | | SVLLNIQEIK | | LKNPGRYQIM | | KERGKRSSEH | | IHHIDLDVRT |
TLRNHVFFRD | | RYGAKQRELF | | YILLAYSEYN | | PEVGYCRDLS | | HITALFLLYL |
PEEDAFWALV | | QLLASERHSL | | PGFHSPNGGT | | VQGLQDQQEH | | VVPKSQPKTM |
WHQDKEGLCG | | QCASLGCLLR | | NLIDGISLGL | | TLRLWDVYLV | | EGEQVLMPIT |
SIALKVQQKR | | LMKTSRCGLW | | ARLRNQFFDT | | WAMNDDTVLK | | HLRASTKKLT |
RKQGDLPPPA | | KREQGSLAPR | | PVPASRGGKT | | LCKGYRQAPP | | GPPAQFQRPI |
CSASPPWASR | | FSTPCPGGAV | | REDTYPVGTQ | | GVPSLALAQG | | GPQGSWRFLE |
WKSMPRLPTD | | LDIGGPWFPH | | YDFEWSCWVR | | AISQEDQLAT | | CWQAEHCGEV |
HNKDMSWPEE | | MSFTANSSKI | | DRQKVPTEKG | | ATGLSNLGNT | | CFMNSSIQCV |
SNTQPLTQYF | | ISGRHLYELN | | RTNPIGMKGH | | MAKCYGDLVQ | | ELWSGTQKSV |
APLKLRRTIA | | KYAPKFDGFQ | | QQDSQELLAF | | LLDGLHEDLN | | RVHEKPYVEL |
KDSDGRPDWE | | VAAEAWDNHL | | RRNRSIIVDL | | FHGQLRSQVK | | CKTCGHISVR |
FDPFNFLSLP | | LPMDSYMDLE | | ITVIKLDGTT | | PVRYGLRLNM | | DEKYTGLKKQ |
LRDLCGLNSE | | QILLAEVHDS | | NIKNFPQDNQ | | KVQLSVSGFL | | CAFEIPVPSS |
PISASSPTQI | | DFSSSPSTNG | | MFTLTTNGDL | | PKPIFIPNGM | | PNTVVPCGTE |
KNFTNGMVNG | | HMPSLPDSPF | | TGYIIAVHRK | | MMRTELYFLS | | PQENRPSLFG |
MPLIVPCTVH | | TRKKDLYDAV | | WIQVSWLARP | | LPPQEASIHA | | QDRDNCMGYQ |
YPFTLRVVQK | | DGNSCAWCPQ | | YRFCRGCKID | | CGEDRAFIGN | | AYIAVDWHPT |
ALHLRYQTSQ | | ERVVDKHESV | | EQSRRAQAEP | | INLDSCLRAF | | TSEEELGESE |
MYYCSKCKTH | | CLATKKLDLW | | RLPPFLIIHL | | KRFQFVNDQW | | IKSQKIVRFL |
RESFDPSAFL | | VPRDPALCQH | | KPLTPQGDEL | | SKPRILAREV | | KKVDAQSSAG |
KEDMLLSKSP | | SSLSANISSS | | PKGSPSSSRK | | SGTSCPSSKN | | SSPNSSPRTL |
GRSKGRLRLP | | QIGSKNKPSS | | SKKNLDASKE | | NGAGQICELA | | DALSRGHMRG |
GSQPELVTPQ | | DHEVALANGF | | LYEHEACGNG | | CGDGYSNGQL | | GNHSEEDSTD |
DQREDTHIKP | | IYNLYAISCH | | SGILSGGHYI | | TYAKNPNCKW | | YCYNDSSCEE |
LHPDEIDTDS | | AYILFYEQQG | | IDYAQFLPKI | | DGKKMADTSS | | TDEDSESDYE |
KYSMLQ |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.
Література
- Paulding C.A., Ruvolo M., Haber D.A. (2003). The Tre2 (USP6) oncogene is a hominoid-specific gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 2507—2511. PMID 12604796 DOI:10.1073/pnas.0437015100
- Papa F.R., Hochstrasser M. (1993). The yeast DOA4 gene encodes a deubiquitinating enzyme related to a product of the human tre-2 oncogene. Nature. 366: 313—319. PMID 8247125 DOI:10.1038/366313a0
- Masuda-Robens J.M., Kutney S.N., Qi H., Chou M.M. (2003). The TRE17 oncogene encodes a component of a novel effector pathway for Rho GTPases Cdc42 and Rac1 and stimulates actin remodeling. Mol. Cell. Biol. 23: 2151—2161. PMID 12612085 DOI:10.1128/MCB.23.6.2151-2161.2003
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12629 (англ.) . Архів оригіналу за 15 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P35125 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |