VEGFB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2C7W, 2VWE, 2XAC

Ідентифікатори

Символи

VEGFB, VEGFL, VRF, vascular endothelial growth factor B

Зовнішні ІД

OMIM: 601398 MGI: 106199 HomoloGene: 87131 GeneCards: VEGFB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • chemoattractant activity • growth factor activity • vascular endothelial growth factor receptor 1 binding • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding • vascular endothelial growth factor receptor 3 binding • vascular endothelial growth factor receptor binding
Клітинна компонента	• мембрана • внутрішньоклітинний • extracellular region • platelet alpha granule lumen • міжклітинний простір
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of protein kinase B signaling • cardiac muscle contraction • protein O-linked glycosylation • platelet degranulation • negative regulation of apoptotic process • coronary vasculature development • negative regulation of gene expression • heart development • positive regulation of vascular permeability • positive regulation of vascular wound healing • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of cell division • positive chemotaxis • response to hypoxia • Ангіогенез • positive regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of angiogenesis • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • induction of positive chemotaxis • positive regulation of mast cell chemotaxis • regulation of signaling receptor activity • positive regulation of protein phosphorylation • sprouting angiogenesis • vascular endothelial growth factor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7423


22340

Ensembl


ENSG00000173511


ENSMUSG00000024962

UniProt


P49765


P49766

RefSeq (мРНК)


NM_003377 NM_001243733


NM_001185164 NM_011697

RefSeq (білок)


NP_001230662 NP_003368


NP_001172093 NP_035827

Локус (UCSC)

Хр. 11: 64.23 – 64.24 Mb

Хр. 19: 6.96 – 6.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VEGFB (англ. Vascular endothelial growth factor B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 21 602^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSPLLRRLLL	AALLQLAPAQ	APVSQPDAPG	HQRKVVSWID	VYTRATCQPR
EVVVPLTVEL	MGTVAKQLVP	SCVTVQRCGG	CCPDDGLECV	PTGQHQVRMQ
ILMIRYPSSQ	LGEMSLEEHS	QCECRPKKKD	SAVKPDRAAT	PHHRPQPRSV
PGWDSAPGAP	SPADITHPTP	APGPSAHAAP	STTSALTPGP	AAAAADAAAS
SVAKGGA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Iyer S., Scotney P.D., Nash A.D., Ravi Acharya K. (2006). Crystal structure of human vascular endothelial growth factor-B: identification of amino acids important for receptor binding. J. Mol. Biol. 359: 76—85. PMID 16616187 DOI:10.1016/j.jmb.2006.03.002

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12681 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P49765 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.