VPS11

Ідентифікатори

Символи

VPS11, END1, PEP5, RNF108, hHLD12, CORVET/HOPS core subunit, VPS11 core subunit of CORVET and HOPS complexes

Зовнішні ІД

OMIM: 608549 MGI: 1918982 HomoloGene: 6673 GeneCards: VPS11

Пов'язані генетичні захворювання

hypomyelinating leukodystrophy 12^[1]

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • protein-macromolecule adaptor activity • protein domain specific binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding
Клітинна компонента	• HOPS complex • ендосома • late endosome • late endosome membrane • мембрана • endocytic vesicle • autophagosome • lysosomal membrane • early endosome • лізосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle
Біологічний процес	• endosomal vesicle fusion • regulation of protein stability • regulation of organelle assembly • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • endosome to lysosome transport • автофагія • positive regulation of early endosome to late endosome transport • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • regulation of SNARE complex assembly • lysosome organization • endosome organization • vesicle docking involved in exocytosis • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55823


71732

Ensembl


ENSG00000160695 ENSG00000280616


ENSMUSG00000032127

UniProt


Q9H270


Q91W86

RefSeq (мРНК)


NM_001290185 NM_021729


NM_027889 NM_001357393

RefSeq (білок)

NP_001277114 NP_068375 NP_001365147 NP_001365148 NP_001365149
NP_001365150


NP_082165 NP_001344322

Локус (UCSC)

Хр. 11: 119.07 – 119.08 Mb

Хр. 9: 44.26 – 44.27 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VPS11 (англ. VPS11, CORVET/HOPS core subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 107 837^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAYLQWRRF	VFFDKELVKE	PLSNDGAAPG	ATPASGSAAS	KFLCLPPGIT
VCDSGRGSLV	FGDMEGQIWF	LPRSLQLTGF	QAYKLRVTHL	YQLKQHNILA
SVGEDEEGIN	PLVKIWNLEK	RDGGNPLCTR	IFPAIPGTEP	TVVSCLTVHE
NLNFMAIGFT	DGSVTLNKGD	ITRDRHSKTQ	ILHKGNYPVT	GLAFRQAGKT
THLFVVTTEN	VQSYIVSGKD	YPRVELDTHG	CGLRCSALSD	PSQDLQFIVA
GDECVYLYQP	DERGPCFAFE	GHKLIAHWFR	GYLIIVSRDR	KVSPKSEFTS
RDSQSSDKQI	LNIYDLCNKF	IAYSTVFEDV	VDVLAEWGSL	YVLTRDGRVH
ALQEKDTQTK	LEMLFKKNLF	EMAINLAKSQ	HLDSDGLAQI	FMQYGDHLYS
KGNHDGAVQQ	YIRTIGKLEP	SYVIRKFLDA	QRIHNLTAYL	QTLHRQSLAN
ADHTTLLLNC	YTKLKDSSKL	EEFIKKKSES	EVHFDVETAI	KVLRQAGYYS
HALYLAENHA	HHEWYLKIQL	EDIKNYQEAL	RYIGKLPFEQ	AESNMKRYGK
ILMHHIPEQT	TQLLKGLCTD	YRPSLEGRSD	REAPGCRANS	EEFIPIFANN
PRELKAFLEH	MSEVQPDSPQ	GIYDTLLELR	LQNWAHEKDP	QVKEKLHAEA
ISLLKSGRFC	DVFDKALVLC	QMHDFQDGVL	YLYEQGKLFQ	QIMHYHMQHE
QYRQVISVCE	RHGEQDPSLW	EQALSYFARK	EEDCKEYVAA	VLKHIENKNL
MPPLLVVQTL	AHNSTATLSV	IRDYLVQKLQ	KQSQQIAQDE	LRVRRYREET
TRIRQEIQEL	KASPKIFQKT	KCSICNSALE	LPSVHFLCGH	SFHQHCFESY
SESDADCPTC	LPENRKVMDM	IRAQEQKRDL	HDQFQHQLRC	SNDSFSVIAD
YFGRGVFNKL	TLLTDPPTAR	LTSSLEAGLQ	RDLLMHSRRG	T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, автофагія, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Poteryaev D., Datta S., Ackema K., Zerial M., Spang A. (2010). Identification of the switch in early-to-late endosome transition. Cell. 141: 497—508. PMID 20434987 DOI:10.1016/j.cell.2010.03.011
Solinger J.A., Spang A. (2013). Tethering complexes in the endocytic pathway: CORVET and HOPS. FEBS J. 280: 2743—2757. PMID 23351085 DOI:10.1111/febs.12151
Perini E.D., Schaefer R., Stoeter M., Kalaidzidis Y., Zerial M. (2014). Mammalian CORVET is required for fusion and conversion of distinct early endosome subpopulations. Traffic. 15: 1366—1389. PMID 25266290 DOI:10.1111/tra.12232
Wartosch L., Guenesdogan U., Graham S.C., Luzio J.P. (2015). Recruitment of VPS33A to HOPS by VPS16 Is Required for Lysosome Fusion with Endosomes and Autophagosomes. Traffic. 16: 727—742. PMID 25783203 DOI:10.1111/tra.12283

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з VPS11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з VPS11 core subunit of CORVET and HOPS complexes переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14583 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H270 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.