WWP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4Y07

Ідентифікатори

Символи

WWP2, AIP2, WWp2-like, WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602308 MGI: 1914144 HomoloGene: 48490 GeneCards: WWP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transcription factor binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• мембрана • ubiquitin ligase complex • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of gene expression • negative regulation of protein transport • regulation of potassium ion transmembrane transporter activity • viral entry into host cell • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transporter activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein K63-linked ubiquitination • extracellular transport • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • negative regulation of Notch signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11060


66894

Ensembl


ENSG00000198373


ENSMUSG00000031930

UniProt


O00308


Q9DBH0

RefSeq (мРНК)


NM_001270453 NM_001270454 NM_001270455 NM_007014 NM_199424


NM_025830

RefSeq (білок)


NP_001257382 NP_001257383 NP_001257384 NP_008945 NP_955456


NP_080106

Локус (UCSC)

Хр. 16: 69.76 – 69.94 Mb

Хр. 8: 108.16 – 108.29 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WWP2 (англ. WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 870 амінокислот, а молекулярна маса — 98 912^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASASSSRAG	VALPFEKSQL	TLKVVSAKPK	VHNRQPRINS	YVEVAVDGLP
SETKKTGKRI	GSSELLWNEI	IILNVTAQSH	LDLKVWSCHT	LRNELLGTAS
VNLSNVLKNN	GGKMENMQLT	LNLQTENKGS	VVSGGELTIF	LDGPTVDLGN
VPNGSALTDG	SQLPSRDSSG	TAVAPENRHQ	PPSTNCFGGR	SRTHRHSGAS
ARTTPATGEQ	SPGARSRHRQ	PVKNSGHSGL	ANGTVNDEPT	TATDPEEPSV
VGVTSPPAAP	LSVTPNPNTT	SLPAPATPAE	GEEPSTSGTQ	QLPAAAQAPD
ALPAGWEQRE	LPNGRVYYVD	HNTKTTTWER	PLPPGWEKRT	DPRGRFYYVD
HNTRTTTWQR	PTAEYVRNYE	QWQSQRNQLQ	GAMQHFSQRF	LYQSSSASTD
HDPLGPLPPG	WEKRQDNGRV	YYVNHNTRTT	QWEDPRTQGM	IQEPALPPGW
EMKYTSEGVR	YFVDHNTRTT	TFKDPRPGFE	SGTKQGSPGA	YDRSFRWKYH
QFRFLCHSNA	LPSHVKISVS	RQTLFEDSFQ	QIMNMKPYDL	RRRLYIIMRG
EEGLDYGGIA	REWFFLLSHE	VLNPMYCLFE	YAGKNNYCLQ	INPASSINPD
HLTYFRFIGR	FIAMALYHGK	FIDTGFTLPF	YKRMLNKRPT	LKDLESIDPE
FYNSIVWIKE	NNLEECGLEL	YFIQDMEILG	KVTTHELKEG	GESIRVTEEN
KEEYIMLLTD	WRFTRGVEEQ	TKAFLDGFNE	VAPLEWLRYF	DEKELELMLC
GMQEIDMSDW	QKSTIYRHYT	KNSKQIQWFW	QVVKEMDNEK	RIRLLQFVTG
TCRLPVGGFA	ELIGSNGPQK	FCIDKVGKET	WLPRSHTCFN	RLDLPPYKSY
EQLREKLLYA	IEETEGFGQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Galinier R., Gout E., Lortat-Jacob H., Wood J., Chroboczek J. (2002). Adenovirus protein involved in virus internalization recruits ubiquitin-protein ligases. Biochemistry. 41: 14299—14305. PMID 12450395 DOI:10.1021/bi020125b
Harvey K.F., Shearwin-Whyatt L.M., Fotia A., Parton R.G., Kumar S. (2002). N4WBP5, a potential target for ubiquitination by the Nedd4 family of proteins, is a novel Golgi-associated protein. J. Biol. Chem. 277: 9307—9317. PMID 11748237 DOI:10.1074/jbc.M110443200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Mund T., Pelham H.R. (2009). Control of the activity of WW-HECT domain E3 ubiquitin ligases by NDFIP proteins. EMBO Rep. 10: 501—507. PMID 19343052 DOI:10.1038/embor.2009.30
Gilmore-Hebert M., Ramabhadran R., Stern D.F. (2010). Interactions of ErbB4 and Kap1 connect the growth factor and DNA damage response pathways. Mol. Cancer Res. 8: 1388—1398. PMID 20858735 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-10-0042

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16804 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00308 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.