XAB2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | XAB2, HCNP, HCRN, NTC90, SYF1, XPA binding protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610850 MGI: 1914689 HomoloGene: 5738 GeneCards: XAB2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро • Prp19 complex • prespliceosome • catalytic step 1 spliceosome • post-mRNA release spliceosomal complex • U2-type catalytic step 2 spliceosome |
---|
Біологічний процес | • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • Сплайсинг РНК • cerebral cortex development • transcription-coupled nucleotide-excision repair • blastocyst development • GO:0100026 Репарація ДНК • mRNA splicing, via spliceosome • generation of catalytic spliceosome for first transesterification step |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 7.62 – 7.63 Mb | Хр. 8: 3.66 – 3.67 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
XAB2 (англ. XPA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 100 010[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVVMARLSRP | | ERPDLVFEEE | | DLPYEEEIMR | | NQFSVKCWLR | | YIEFKQGAPK |
PRLNQLYERA | | LKLLPCSYKL | | WYRYLKARRA | | QVKHRCVTDP | | AYEDVNNCHE |
RAFVFMHKMP | | RLWLDYCQFL | | MDQGRVTHTR | | RTFDRALRAL | | PITQHSRIWP |
LYLRFLRSHP | | LPETAVRGYR | | RFLKLSPESA | | EEYIEYLKSS | | DRLDEAAQRL |
ATVVNDERFV | | SKAGKSNYQL | | WHELCDLISQ | | NPDKVQSLNV | | DAIIRGGLTR |
FTDQLGKLWC | | SLADYYIRSG | | HFEKARDVYE | | EAIRTVMTVR | | DFTQVFDSYA |
QFEESMIAAK | | METASELGRE | | EEDDVDLELR | | LARFEQLISR | | RPLLLNSVLL |
RQNPHHVHEW | | HKRVALHQGR | | PREIINTYTE | | AVQTVDPFKA | | TGKPHTLWVA |
FAKFYEDNGQ | | LDDARVILEK | | ATKVNFKQVD | | DLASVWCQCG | | ELELRHENYD |
EALRLLRKAT | | ALPARRAEYF | | DGSEPVQNRV | | YKSLKVWSML | | ADLEESLGTF |
QSTKAVYDRI | | LDLRIATPQI | | VINYAMFLEE | | HKYFEESFKA | | YERGISLFKW |
PNVSDIWSTY | | LTKFIARYGG | | RKLERARDLF | | EQALDGCPPK | | YAKTLYLLYA |
QLEEEWGLAR | | HAMAVYERAT | | RAVEPAQQYD | | MFNIYIKRAA | | EIYGVTHTRG |
IYQKAIEVLS | | DEHAREMCLR | | FADMECKLGE | | IDRARAIYSF | | CSQICDPRTT |
GAFWQTWKDF | | EVRHGNEDTI | | KEMLRIRRSV | | QATYNTQVNF | | MASQMLKVSG |
SATGTVSDLA | | PGQSGMDDMK | | LLEQRAEQLA | | AEAERDQPLR | | AQSKILFVRS |
DASREELAEL | | AQQVNPEEIQ | | LGEDEDEDEM | | DLEPNEVRLE | | QQSVPAAVFG |
SLKED |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14089 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9HCS7 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |