ZFYVE1

Ідентифікатори

Символи

ZFYVE1, DFCP1, PPP1R172, SR3, TAFF1, ZNFN2A1, zinc finger FYVE-type containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605471 MGI: 3026685 HomoloGene: 10945 GeneCards: ZFYVE1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding
Клітинна компонента	• perinuclear region of cytoplasm • autophagosome • mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane • Golgi stack • комплекс Ґольджі • extrinsic component of omegasome membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • phagophore assembly site • omegasome
Біологічний процес	• negative regulation of phosphatase activity • cellular response to starvation • macroautophagy
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


53349


217695

Ensembl


ENSG00000165861


ENSMUSG00000042628

UniProt


Q9HBF4


Q810J8

RefSeq (мРНК)


NM_001281734 NM_001281735 NM_021260 NM_178441


NM_183154 NM_001359166 NM_001359167 NM_001359168

RefSeq (білок)


NP_001268663 NP_001268664 NP_067083 NP_848535


NP_898977 NP_001346095 NP_001346096 NP_001346097

Локус (UCSC)

Хр. 14: 72.97 – 73.03 Mb

Хр. 12: 83.59 – 83.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZFYVE1 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 777 амінокислот, а молекулярна маса — 87 176^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAQTSPAEK	GLNPGLMCQE	SYACSGTDEA	IFECDECCSL	QCLRCEEELH
RQERLRNHER	IRLKPGHVPY	CDLCKGLSGH	LPGVRQRAIV	RCQTCKINLC
LECQKRTHSG	GNKRRHPVTV	YNVSNLQESL	EAEEMDEETK	RKKMTEKVVS
FLLVDENEEI	QVTNEEDFIR	KLDCKPDQHL	KVVSIFGNTG	DGKSHTLNHT
FFYGREVFKT	SPTQESCTVG	VWAAYDPVHK	VAVIDTEGLL	GATVNLSQRT
RLLLKVLAIS	DLVIYRTHAD	RLHNDLFKFL	GDASEAYLKH	FTKELKATTA
RCGLDVPLST	LGPAVIIFHE	TVHTQLLGSD	HPSEVPEKLI	QDRFRKLGRF
PEAFSSIHYK	GTRTYNPPTD	FSGLRRALEQ	LLENNTTRSP	RHPGVIFKAL
KALSDRFSGE	IPDDQMAHSS	FFPDEYFTCS	SLCLSCGVGC	KKSMNHGKEG
VPHEAKSRCR	YSHQYDNRVY	TCKACYERGE	EVSVVPKTSA	STDSPWMGLA
KYAWSGYVIE	CPNCGVVYRS	RQYWFGNQDP	VDTVVRTEIV	HVWPGTDGFL
KDNNNAAQRL	LDGMNFMAQS	VSELSLGPTK	AVTSWLTDQI	APAYWRPNSQ
ILSCNKCATS	FKDNDTKHHC	RACGEGFCDS	CSSKTRPVPE	RGWGPAPVRV
CDNCYEARNV	QLAVTEAQVD	DEGGTLIARK	VGEAVQNTLG	AVVTAIDIPL
GLVKDAARPA	YWVPDHEILH	CHNCRKEFSI	KLSKHHCRAC	GQGFCDECSH
DRRAVPSRGW	DHPVRVCFNC	NKKPGDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

Derubeis A.R., Young M.F., Jia L., Robey P.G., Fisher L.W. (2000). Double FYVE-containing protein 1 (DFCP1): isolation, cloning and characterization of a novel FYVE finger protein from a human bone marrow cDNA library. Gene. 255: 195—203. PMID 11024279 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00303-6
Cheung P.C.F., Trinkle-Mulcahy L., Cohen P., Lucocq J.M. (2001). Characterization of a novel phosphatidylinositol 3-phosphate-binding protein containing two FYVE fingers in tandem that is targeted to the Golgi. Biochem. J. 355: 113—121. PMID 11256955 DOI:10.1042/0264-6021:3550113
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tomar D., Singh R., Singh A.K., Pandya C.D., Singh R. (2012). TRIM13 regulates ER stress induced autophagy and clonogenic ability of the cells. Biochim. Biophys. Acta. 1823: 316—326. PMID 22178386 DOI:10.1016/j.bbamcr.2011.11.015

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13180 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9HBF4 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.