ZMYM2

Ідентифікатори

Символи

ZMYM2, FIM, MYM, RAMP, SCLL, ZNF198, zinc finger MYM-type containing 2, NECRC

Зовнішні ІД

OMIM: 602221 MGI: 1923257 HomoloGene: 12631 GeneCards: ZMYM2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • ubiquitin conjugating enzyme binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • protein tyrosine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • клітинне ядро • PML body • цитоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cytoskeleton organization • regulation of cell morphogenesis • multicellular organism development • peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7750


76007

Ensembl


ENSG00000121741


ENSMUSG00000021945

UniProt


Q9UBW7


Q9CU65

RefSeq (мРНК)

NM_001190964 NM_001190965 NM_003453 NM_197968 NM_001353157
NM_001353159 NM_001353161 NM_001353162 NM_001353163 NM_001353164 NM_001353165


NM_029498 NM_177627 NM_001360643

RefSeq (білок)

NP_001177893 NP_001177894 NP_003444 NP_932072 NP_001340086
NP_001340088 NP_001340090 NP_001340091 NP_001340092 NP_001340093 NP_001340094


NP_083774 NP_001347572 NP_808295

Локус (UCSC)

Хр. 13: 19.96 – 20.09 Mb

Хр. 14: 57.12 – 57.2 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZMYM2 (англ. Zinc finger MYM-type containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 377 амінокислот, а молекулярна маса — 154 911^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDTSSVGGLE	LTDQTPVLLG	STAMATSLTN	VGNSFSGPAN	PLVSRSNKFQ
NSSVEDDDDV	VFIEPVQPPP	PSVPVVADQR	TITFTSSKNE	ELQGNDSKIT
PSSKELASQK	GSVSETIVID	DEEDMETNQG	QEKNSSNFIE	RRPPETKNRT
NDVDFSTSSF	SRSKVNAGMG	NSGITTEPDS	EIQIANVTTL	ETGVSSVNDG
QLENTDGRDM	NLMITHVTSL	QNTNLGDVSN	GLQSSNFGVN	IQTYTPSLTS
QTKTGVGPFN	PGRMNVAGDV	FQNGESATHH	NPDSWISQSA	SFPRNQKQPG
VDSLSPVASL	PKQIFQPSVQ	QQPTKPVKVT	CANCKKPLQK	GQTAYQRKGS
AHLFCSTTCL	SSFSHKPAPK	KLCVMCKKDI	TTMKGTIVAQ	VDSSESFQEF
CSTSCLSLYE	DKQNPTKGAL	NKSRCTICGK	LTEIRHEVSF	KNMTHKLCSD
HCFNRYRMAN	GLIMNCCEQC	GEYLPSKGAG	NNVLVIDGQQ	KRFCCQSCVS
EYKQVGSHPS	FLKEVRDHMQ	DSFLMQPEKY	GKLTTCTGCR	TQCRFFDMTQ
CIGPNGYMEP	YCSTACMNSH	KTKYAKSQSL	GIICHFCKRN	SLPQYQATMP
DGKLYNFCNS	SCVAKFQALS	MQSSPNGQFV	APSDIQLKCN	YCKNSFCSKP
EILEWENKVH	QFCSKTCSDD	YKKLHCIVTY	CEYCQEEKTL	HETVNFSGVK
RPFCSEGCKL	LYKQDFARRL	GLRCVTCNYC	SQLCKKGATK	ELDGVVRDFC
SEDCCKKFQD	WYYKAARCDC	CKSQGTLKER	VQWRGEMKHF	CDQHCLLRFY
CQQNEPNMTT	QKGPENLHYD	QGCQTSRTKM	TGSAPPPSPT	PNKEMKNKAV
LCKPLTMTKA	TYCKPHMQTK	SCQTDDTWRT	EYVPVPIPVP	VYIPVPMHMY
SQNIPVPTTV	PVPVPVPVFL	PAPLDSSEKI	PAAIEELKSK	VSSDALDTEL
LTMTDMMSED	EGKTETTNIN	SVIIETDIIG	SDLLKNSDPE	TQSSMPDVPY
EPDLDIEIDF	PRAAEELDME	NEFLLPPVFG	EEYEEQPRPR	SKKKGAKRKA
VSGYQSHDDS	SDNSECSFPF	KYTYGVNAWK	HWVKTRQLDE	DLLVLDELKS
SKSVKLKEDL	LSHTTAELNY	GLAHFVNEIR	RPNGENYAPD	SIYYLCLGIQ
EYLCGSNRKD	NIFIDPGYQT	FEQELNKILR	SWQPSILPDG	SIFSRVEEDY
LWRIKQLGSH	SPVALLNTLF	YFNTKYFGLK	TVEQHLRLSF	GTVFRHWKKN
PLTMENKACL	RYQVSSLCGT	DNEDKITTGK	RKHEDDEPVF	EQIENTANPS
RCPVKMFECY	LSKSPQNLNQ	RMDVFYLQPE	CSSSTDSPVW	YTSTSLDRNT
LENMLVRVLL	VKDIYDKDNY	ELDEDTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Kulkarni S., Reiter A.J., Smedley D., Goldman J.M., Cross N.C.P. (1999). The genomic structure of ZNF198 and location of breakpoints in the t(8;13) myeloproliferative syndrome. Genomics. 55: 118—121. PMID 9889006 DOI:10.1006/geno.1998.5634
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 DOI:10.1074/jbc.M208992200
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Still I.H., Cowell J.K. (1998). The t(8;13) atypical myeloproliferative disorder: further analysis of the ZNF198 gene and lack of evidence for multiple genes disrupted on chromosome 13. Blood. 92: 1456—1458. PMID 9694738

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12989 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UBW7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.