Ganna se na profesionální scéně objevil v roce 2016 na dráhovém mistrovství světa s neobvyklým stíhacím stylem negativního rozkolu, kdy začátek závodu absolvoval pomaleji a postupně zrychloval v druhé polovině, což mu přineslo vítězství. V roce 2016 Ganna jezdil za italský amatérský tým Team Colpack.[3] Následující rok pak začal reprezentovat barvy UCI WorldTeamuUAE Abu Dhabi, s nímž strávil i sezónu 2018.[4] V říjnu 2018 pak bylo oznámeno, že Ganna podepsal dvouletý kontrakt s UCI WorldTeamemTeam Sky od sezóny 2019.[5]
Od listopadu 2019 do února 2020 Ganna stanovil třikrát nový světový rekord v individuální stíhačce. Rekord postupně stáhl z času 4 minut 5 sekund až na čas 4 minut 1,934 sekund, který zajel na mistrovství světa v dráhové cyklistice 2020 v Berlíně.[8][9]
Na letních olympijských hrách 2020 konaných v Tokiu v roce 2021 vyhrál Ganna společně s Jonathanem Milanem, Francescem Lamonem a Simonem Consonnim zlatou medaili v týmové stíhačce. Dvakrát se jim podařilo stanovit nový světový rekord, nejprve v třetím vyřazovacím kole proti sestavě Nového Zélandu a podruhé ve finále proti Dánsku, kde zajeli čas 3 minut a 42,02 sekund. Již v kvalifikaci italský tým stanovil nový olympijský rekord, ten však byl krátce poté překonán Dány.[10] Na olympiádě v Paříži v roce 2024 skončil s italským týmem ve stejné disciplíně na třetím místě.[11]
8. října 2022 Ganna stanovil nový hodinový rekord, když za 1 hodinu na velodromu ve švýcarskémGrenchenu ujel 56,792 km, čímž porazil předchozí rekord Daniela Bighama, jenž 19. srpna téhož roku ujel 55,548 km.[12][13]
↑ abSCOGNAMIGLIO, Ciro. Che bravo Ganna: vince in Croazia [online]. gazzetta.it, 2016-02-14 [cit. 2023-03-18]. Dostupné online. (italsky)
↑ abSaronni reveals how he secured UAE Abu Dhabi's WorldTour licence [online]. cyclingnews.com, 2016-12-26 [cit. 2023-03-18]. Dostupné online. (anglicky)
↑ abItaly's Filippo Ganna joins Team Sky for 2019 [online]. cyclingnews.com, 2018-10-19 [cit. 2023-03-18]. Dostupné online. (anglicky)
↑Team Ineos [online]. UCI, 2020-01-01 [cit. 2023-02-04]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2020-01-02. (anglicky)
↑INEOS GRENADIERS [online]. UCI, 2024-01-01 [cit. 2024-01-02]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2024-01-02. (anglicky)
↑SMYTHE, Simon. Four, the record: Inside the race to smash the Individual Pursuit four-minute barrier [online]. cyclingweekly.com, 2020-02-16 [cit. 2023-03-19]. Dostupné online. (anglicky)
↑LONG, Jonny. Filippo Ganna breaks own individual pursuit world record at Berlin Track World Championships [online]. cyclingweekly.com, 2020-02-28 [cit. 2023-03-19]. Dostupné online. (anglicky)
↑FARRAND, Stephen. Italian riders reveal how they set up Ganna to defeat Denmark and win Olympic team pursuit gold [online]. cyclingnews.com, 2021-08-04 [cit. 2023-03-19]. Dostupné online. (anglicky)
↑ Italy Competes for Bronze in Track Cycling at Paris 2024 Olympics. www.ilmessaggero.it [online]. 2024-08-07 [cit. 2024-08-09]. Dostupné online. (anglicky)
↑Filippo Ganna smashes cycling's hour world record [online]. bbc.com, 2022-10-08 [cit. 2023-03-19]. Dostupné online. (anglicky)
↑FILIPPO GANNA: INEOS GRENADIERS RIDER OBLITERATES HOUR RECORD WITH STUNNING SHOWING IN GRENCHEN, SWITZERLAND [online]. eurosport.com, 2022-10-08 [cit. 2023-03-19]. Dostupné online. (anglicky)