ADAMTS5 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1a/PDB_2rjq_EBI.png/250px-PDB_2rjq_EBI.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2RJQ, 3B8Z, 3HY7, 3HY9, 3HYG, 3LJT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ADAMTS5, ADAM-TS 11, ADAM-TS 5, ADAM-TS5, ADAMTS-11, ADAMTS-5, ADAMTS11, ADMP-2, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605007 MGI: 1346321 HomoloGene: 5109 GeneCards: ADAMTS5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • heparin binding • zinc ion binding • extracellular matrix binding • зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • extracellular matrix disassembly • протеоліз • defense response to bacterium • Прорізування зубів • negative regulation of cold-induced thermogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 21: 26.92 – 26.97 Mb | Хр. 16: 85.65 – 85.7 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ADAMTS5 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 101 718[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLLGWASLLL | | CAFRLPLAAV | | GPAATPAQDK | | AGQPPTAAAA | | AQPRRRQGEE |
VQERAEPPGH | | PHPLAQRRRS | | KGLVQNIDQL | | YSGGGKVGYL | | VYAGGRRFLL |
DLERDGSVGI | | AGFVPAGGGT | | SAPWRHRSHC | | FYRGTVDGSP | | RSLAVFDLCG |
GLDGFFAVKH | | ARYTLKPLLR | | GPWAEEEKGR | | VYGDGSARIL | | HVYTREGFSF |
EALPPRASCE | | TPASTPEAHE | | HAPAHSNPSG | | RAALASQLLD | | QSALSPAGGS |
GPQTWWRRRR | | RSISRARQVE | | LLLVADASMA | | RLYGRGLQHY | | LLTLASIANR |
LYSHASIENH | | IRLAVVKVVV | | LGDKDKSLEV | | SKNAATTLKN | | FCKWQHQHNQ |
LGDDHEEHYD | | AAILFTREDL | | CGHHSCDTLG | | MADVGTICSP | | ERSCAVIEDD |
GLHAAFTVAH | | EIGHLLGLSH | | DDSKFCEETF | | GSTEDKRLMS | | SILTSIDASK |
PWSKCTSATI | | TEFLDDGHGN | | CLLDLPRKQI | | LGPEELPGQT | | YDATQQCNLT |
FGPEYSVCPG | | MDVCARLWCA | | VVRQGQMVCL | | TKKLPAVEGT | | PCGKGRICLQ |
GKCVDKTKKK | | YYSTSSHGNW | | GSWGSWGQCS | | RSCGGGVQFA | | YRHCNNPAPR |
NNGRYCTGKR | | AIYRSCSLMP | | CPPNGKSFRH | | EQCEAKNGYQ | | SDAKGVKTFV |
EWVPKYAGVL | | PADVCKLTCR | | AKGTGYYVVF | | SPKVTDGTEC | | RLYSNSVCVR |
GKCVRTGCDG | | IIGSKLQYDK | | CGVCGGDNSS | | CTKIVGTFNK | | KSKGYTDVVR |
IPEGATHIKV | | RQFKAKDQTR | | FTAYLALKKK | | NGEYLINGKY | | MISTSETIID |
INGTVMNYSG | | WSHRDDFLHG | | MGYSATKEIL | | IVQILATDPT | | KPLDVRYSFF |
VPKKSTPKVN | | SVTSHGSNKV | | GSHTSQPQWV | | TGPWLACSRT | | CDTGWHTRTV |
QCQDGNRKLA | | KGCPLSQRPS | | AFKQCLLKKC |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hurskainen T.L., Hirohata S., Seldin M.F., Apte S.S. (1999). ADAM-TS5, ADAM-TS6, and ADAM-TS7, novel members of a new family of zinc metalloproteases. J. Biol. Chem. 274: 25555—25563. PMID 10464288 DOI:10.1074/jbc.274.36.25555
- Wang L.W., Leonhard-Melief C., Haltiwanger R.S., Apte S.S. (2009). Post-translational modification of thrombospondin type-1 repeats in ADAMTS-like 1/punctin-1 by C-mannosylation of tryptophan. J. Biol. Chem. 284: 30004—30015. PMID 19671700 DOI:10.1074/jbc.M109.038059
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:221 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UNA0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM | |
---|
Матриксні металопротеїнази | |
---|
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |